齐豫州刺史垣崇祖听说北魏大军前来，不慌不忙，反利用魏军轻敌的心态设下一计，狠狠地给了魏军一个教训。梁郡王拓跋嘉狼狈北逃，退出豫州。捷报传到京都，齐主萧道成高兴地对朝臣说：“朕就知道他能制敌，崇祖真是朕的韩信呀！”随即将垣崇祖召进宫，封他为平西将军。垣崇祖担心魏军转而入侵淮北，因而上奏恳请将下蔡城迁到淮东。
这年夏天，魏兵果然来攻下蔡。听说下蔡城已经迁址，魏军扬言要踏平下蔡城旧址。桓崇祖麾下的部将都怕胡虏在下蔡旧城屯驻，桓崇祖却说：“下蔡距离这里很近，胡虏怎敢屯兵？不过在平城示威罢了。走，给他们一个下马威去！”随即率军渡过淮河。魏兵正在毁掘城址，突然见垣崇祖军杀来，顿时吓得丢下器械，匆匆撤退。垣崇祖趁势追杀数十里，斩获数千人，才收军回城。自此，垣祟祖威名远震。
第二年，魏兵入侵淮阳，又被齐军杀得大败而还。从此，北魏再也不敢窥探齐境了。刘昶也打消了光复故国的念头，沮丧地回到平城。
不久，齐主派参军车僧朗去北魏通好。魏主拓跋宏问车僧朗说：“齐主原本辅助宋主，怎么突然就登上大位了呢？”车僧朗回答说：“因时制宜。”魏主也不加辩驳，只是在赐宴的时候，安排刘宋的使者坐车僧朗的上手。这位使者因刘宋破灭、萧齐篡位而被迫留住北魏都城。车僧朗不肯就席，又见使者出言不逊，一怒之下，拂袖而出，回客馆待命去了。刘昶随即派人刺杀了车僧朗。魏主拓跋宏对此很不赞成，当即用隆重的仪仗队伍将车僧朗的灵柩送回萧齐，并将刘宋使者打发回去。齐主萧道成本想趁机兴兵北伐，只因年将花甲，精力不济，只得作罢。
好不容易过了四年，褚渊已晋升为司徒；豫章王萧嶷晋升为司空，并获得骠骑大将军的称号，兼任扬州刺史；临川王萧映为前将军，担任荆州刺史；长沙王萧晃为后将军，兼护军将军，南郡王萧长懋为南徐州刺史；安成王萧暠为江州刺史；江州刺史王延之被召回宫，担任右光禄大夫。不久，齐主疾病缠身，疼痛难忍，自知大限已到，忙将司徒褚渊、左仆射王俭召到临光殿，嘱咐他们用心辅佐新帝。
两天后，齐主在临光殿逝世，享年五十六岁，在位四年。太子萧赜嗣位，追尊父亲为高皇帝，庙号太祖，将父亲安葬在泰安陵。齐主萧道成秉性勤俭，喜怒不形于色，博涉经史。即位后，穿着简朴，并将后宫所有铜装饰品换成铁制品。他还曾对身边的人说：“十年之内，我要让黄金与土地一个价格。”萧道成病故后，嗣主萧赜继承父亲的遗风，将俭约的之风发扬光大。萧赜小字龙儿，母亲为刘昭皇后。据说刘皇后生萧赜时，曾梦见有巨龙盘踞在屋顶上空，所以萧赜的字为龙儿。萧赜自小得到父亲萧道成的亲自教导，颇具韬略，后来屡立战功，深受父亲的器重，得以继承大位。
即位后，萧赜任命司徒褚渊为录尚书事，尚书左仆射王俭为尚书令，车骑将军张敬儿为开府仪同三司，司空豫章王萧嶷为太尉，追册已故太子妃裴氏为皇后。裴氏是左军参军裴玑的女儿，建元三年病故，谥号穆，即穆皇后。齐主萧赜册立长子萧长懋为太子，二皇子萧子良为竟陵王，三皇子萧子卿为庐陵王，四皇子萧子响过继给豫章王萧嶷，所以没有封邑，五皇子萧子敬为安陆王，六皇子早夭，七皇子萧子懋为晋安王，八皇子萧子隆为随郡王，九皇子萧子真为建安王，十皇子萧子明为武昌王，十一皇子萧子罕为南海王，其他的皇子因为年幼，暂时没有封爵。齐主还有几个弟弟，也因为年幼，暂时没有封爵。太子萧长懋的儿子萧昭业被封为南郡王。司徒褚渊又晋升为司空。
不久，齐主萧赜在东宫宴饮群臣。席间，右卫率沈文季与褚渊互相揶揄，二人越谈越不投机。褚渊不肯相让，沈文季愤怒地说：“你自以为是忠臣，只是不知你死了，怎么去见九泉下的宋明帝？”褚渊恼羞成怒，起座想走，还是齐主萧赜好言劝解，他才忍耐到散席。
第二天入朝，天气盛热，红日东升，褚渊用扇子遮住脸。功曹刘祥当即从旁揶揄道：“做了那样不堪的事，怪不得没脸见人！但是用扇子遮脸，有什么用呢？”褚渊一听，羞惭地低下头。自此，越发觉得羞愧，竟愤懑谢世，享年四十八岁。褚渊的长子褚贲曾是翊军校尉，父亲去世后，他便辞官守孝。孝期过后，齐主想起用他，他却委婉推辞。甚至连父亲南康公的爵位，褚贲都推让给弟弟褚蓁，随后远离仕途，终生为父亲守墓。
第二年，齐主改元永明，任命豫章王萧嶷为太子太傅，长沙王萧晃为南徐州刺史，竟陵王萧子良为南兖州刺史；并召回豫州刺史垣崇祖，任命他为五兵尚书；改任司空谘议荀伯玉为散骑常侍。萧赜是太子时，为人稳重，办事老练，齐主萧道成经常将朝政交由他处理。朝臣张景真仗着太子萧赜对他的宠信，骄奢蛮横，恣意妄为。当时朝内外竟没有一人敢站出来指责他，唯独司空谘议荀伯玉暗中向萧道成禀报实情。萧道成当即斩杀张景真，并派人诘责太子。太子萧赜因此差点失去储位，因而十分憎恨荀伯玉。荀伯玉越是得到齐主的宠信，萧赜越是憎恨。又因为垣崇祖从来不曾附会萧赜，并且还曾在大破北魏、奉旨回朝时，与萧道成密谈了一晚，萧赜因此也十分猜忌垣崇祖。永明元年，嗣位后的萧嶷将垣崇祖召回京都，然后唆使宁朔将军孙景育诬陷垣崇祖与荀玉伯煽动北魏，图谋不轨，将二人处斩。不久，车骑将军张敬儿贪图富贵，敛聚钱财，齐主萧赜误以为他图谋不轨，将他满门抄斩，只赦免了他的小儿子张道庆。张敬儿在襄阳做员外郎的弟弟张恭儿一得到消息，立即率着数十骑逃入蛮中。
侍中王僧虔是宋太保王弘的侄子。萧道成与王僧虔关系一直很好，所以开国后，特别重用他。萧道成爱好文辞，王僧虔也喜欢文辞，二人曾各自写下一篇文章比试高低。写完后，萧道成笑着拿给王僧虔看，问道：“谁是第一？”王僧虔回答说：“臣是第一，陛下也是第一。”齐祖又笑道：“你可以说是善自为谋了啊！”建元三年，王僧虔出任湘州刺史，督管湘州诸军事。永明改元，齐主萧赜将他召回京都，任命他为侍中左光禄大夫、开府仪同三司。王僧虔几次推辞，他的侄子尚书令王俭很是不解，王僧虔叹道：“你现在已是朝中高官，我再接受官职的话，那就是一门有两位台司，这样岂不更加危险吗？”不久，齐主收回成命，改封王僧虔为侍中特进左光禄大夫。
有人问王僧虔为什么要辞掉殊荣，王僧虔回答说：“君子只担心自己被别人痛骂无德，不担心没人推崇。现在我丰衣足食，正惭愧自己不称职，没能报效国家，哪能再接受更高的爵位呢？而且你又不是没有看见张敬儿的惨祸，全家几乎被诛杀殆尽。就连门第清明的谢超宗也受到连累，你说可怕不可怕？”原来，谢超宗是谢灵运的孙子，勤学好问，颇善文辞。宋孝武帝时，谢超宗是新安王刘子鸾的常侍，后来被孝武帝提拔为新安王参军。齐祖萧道成做领军时，看重谢超宗的才华，引荐他为长史。萧氏禅位后，谢超宗任职黄门郎，后来因失仪而被罢官，谢超宗心中不免有些埋怨。萧赜即位后，竟陵王谘议参军被杀，负责编纂国史的谢超宗更觉得怏怏不得志。谢超宗曾迎娶张敬儿的女儿为儿媳，张敬儿死后，谢超宗对丹阳尹李安民说：“先前杀韩信，现在杀彭越，你也要多为自己打算啊！”没想到李安民竟向齐主告密。齐主萧赜于是将谢超宗罢职，勒令他自尽。
永明三年，王僧虔病逝，齐主追封他为司空，赐谥号简穆。王俭的父亲王僧绰遇害后，王俭便由王僧虔抚养成人。自此，身为养子和侄子的王俭上奏辞官，恳请为叔父守孝。齐主没有允准，只是改任他为太子少傅。太子萧长懋聪明好学，每次与王俭讨论经义时总是问得很仔细，王俭也总是耐心讲解。竟陵王萧子良、临川王萧子映也曾在太子身边陪读，几人互相引证，天演讲学，望重一时。萧子良尤好宾客，招揽文士。永明五年，宋主晋封萧子良为司徒，萧子良却移居鸡笼山，在西邸召集名流，联为文字之交。当时范云、萧琛、任昉、王融、萧衍、谢眺、沈约、陆倕八人都十分有才学，萧子良与他们八人关系很好，号称“八友”。只是太子信佛，萧子良也信佛。东宫曾专门辟出一块地筑造楼观塔宇，萧子良也在西邸中修建几间经室，招揽名僧，天天诵经。范缜屡次劝他说：“这个世界不存在佛祖。”萧子良问道：“没有因果，那为何人生来就有富贵贫贱之别呢？”范缜回答说：“人生与花蕊相似，随风飘荡，有的被吹入帘帐，落在茵席上，有的被吹向篱墙，落在粪坑边。殿下是落在茵席上的花，而我这朵花就落在粪坑边，虽然贵贱悬殊，但这之间并没有什么因果关系。”范缜著有《神灭论》，他认为神附于形，形存神自存，形亡神也亡，绝对没有形亡神存的道理。萧子良因而派王融劝他说：“你这么有才，中书郎的官职可以说是招之即来，为什么你非要矫情立异，浪费自己的才学呢？”范缜笑道：“如果我改变自己的信念去谋取官位，就算不做尚书令，也能做仆射。”
范云是范缜的族兄，萧子良曾恳请齐主晋升范云为郡守。齐主萧赜却说：“听说范云喜欢卖弄小才，我想依法惩治他，就算不重罚，我也想令他远徙。”萧子良为范云辩护道：“臣一有过失，范云便会及时规谏儿臣。范云的劝谏奏章，儿臣都保存着，陛下要是不信，儿臣拿给你看。”范云的劝谏奏章当即被呈了上去，齐主萧赜一看，奏章竟有一百多张，而且张张言辞恳切，直言无忌。他便对萧子良说：“没想到范云竟如此直言不讳，我应该令他好好辅助你，怎么能把他调走呢？”
太子萧长懋曾在东田看百姓收割水稻，对身边的僚佐说：“收割的场面可真壮观啊！”众人都唯唯称是，没有什么评论，唯独范云走上前说：“农务关系着国计民生，臣只愿殿下知道百姓的辛苦，庄稼得来不易，不要贪恋安逸！”太子听了这话，一改笑颜，严肃地向范云道谢。
因国家安定，齐主有志实行文教，于是特意令王俭任国子监祭酒，在王俭的宅第开学士馆，将前代四部书全部充入馆中。王俭向来熟悉礼学，谙熟朝仪、国典，晋、宋两朝的所有旧事，他都牢记心中，当朝办事，判决如流，发言下笔都十分精彩。永明七年，王俭病故，年仅三十八岁。追谥文宪，追封太尉，仍享有南昌公封号。