孝庄皇太后在五月初就接到了明军已占领珲春的消息。她起先不信，认为是逃兵在说谎，因为明军即使想进攻珲春，哪怕从登莱出发，绕过朝xian东部赶到摩阔崴，也有几千里远呢，所以明军不可能进攻珲春。攻陷珲春的可能是从朝xian来的饥民，他们为了抢夺粮食，冒充明军进了珲春城。可怎么对付那些朝鲜饥民？多尔衮率大部人马进关后，整个辽东只留守了2个旗15000人，这些部队大多驻守在盛京周边地区，实在抽不出兵力去平定珲春之乱，于是他派了人去朝xian，让朝xian王派兵镇ya这些乱民。
可十几天后，又从北部传来消息，说是宁古塔地区、三姓地区也被明军占领了，这下孝庄皇太后也搞不懂是怎么回事了？朝鲜饥民不可能，也不敢这么深入我大清腹地作乱。这些地区都是大清的龙兴之地，留在那里的族人也绝对不会反叛，难道真的是明军在摩阔崴登陆了？
不久，100多个驻守在辽阳的士兵逃到了盛京，这些逃回来的残兵说，明军不仅占领了辽阳，连牛庄、耀州、盖州也被明军占领了。进攻辽阳的明军会妖术，会施放一种让人不断流眼泪的烟雾，无论是谁，只要吸进这种妖气，就没了反抗能力。进攻辽阳的明军还有妖兵帮忙，这些妖兵像《西游记》里的猪八戒，有长长的鼻子，杀起人来毫不手软。
这些逃兵还说明军让他们带来了一封信。
孝庄皇太后听了从辽阳跑回来的残兵的话后，才相信明军真的来到了辽东，而且是南北两翼同时行动，如明军真有妖术，又有妖兵帮忙的话，多尔衮留在盛京周边地区的15000人根本挡不住这些明军，而且辽阳距盛京只有100多里路，明军一个急行军，一天就能赶到盛京。
孝庄皇太后从逃兵手里接过信，读着读着，双手开始发抖。这封信是明军一个叫张罗彦的将领写来的，他说如果清军再敢用平民做肉盾，今后明军将不留一个俘虏。她心想，以前只有我大清威胁大明，现在大明竟然也敢用这种口气威胁我大清了，这不是气人吗？原来这跑回来的100多人是被明军俘虏后放回来的，这简直把我大清的军威都丢尽了。
孝庄皇太后盛怒之下，砍了50多个逃兵。
砍了50多个逃兵后，心里是解气了，可想着明军将很快进攻盛京，该怎么办？于是就找来了阿巴泰，想问问他该怎么对付明军？
谁知阿巴泰问了一些情况就，嘴里连着说了几句“糟了”。
孝庄皇太后就问阿巴泰：“怎么糟了？”
阿巴泰说道：“有这么猛烈炮火的明军肯定是南直隶的部队，去年我就是吃了他们的亏。”
“现在我们该怎么办？”
“现在他们又有妖兵帮忙，我们还能怎么办？赶紧跑路。”
“跑路？跑到哪里去？”
“明军来关外，我们就去关内，离他们越远越好，实在不行就躲到漠北去。”
“你......”
“太后，我要去准备准备了，你也赶紧带着皇上动身吧。”
说完，阿巴泰就离开了皇宫，回家去做跑路的准备了。
孝庄皇太后望着阿巴泰的背影，嘴里骂着“胆小鬼”。她一开始想让多尔衮率部回盛京，但想着关内有大片的良田和人口，如多尔衮夺下黄河以北后，即使把关外都让给明廷，用不了多久大清就能中兴，到那时再夺回关外也不迟，因此她决定让多尔衮继续留在北京，与李自成争夺中原。
可多尔衮不回来的话，就靠留守关外的2个旗的清兵能挡住明军吗？阿巴泰说这支来自南直隶的明军十分厉害，前年派去关内劫掠的10万兵马只回来了2万多人，阿巴泰至今还心有余悸。既然明军这么厉害，自己留在盛京的话，恐怕也会成为明军的俘虏，于是还是决定听从阿巴泰的劝告，离开盛京。
想定主意后，孝庄皇太后让伊尔登留守盛京，自己带着福临在拜音图的护送下离开了盛京，准备去北京。
孝庄皇太后离开盛京后，她怕遇到北上的明军，因此不敢向西南方向走，而是向翁合（今阜新）方向走。走到四方城（今彰武）后，遇到了从后边赶来的何洛会。
何洛会从北京赶到盛京时才知道孝庄皇太后、皇上已离开了，于是赶紧追了上来。
孝庄皇太后问何洛会：“你在盛京没遇到明军？”
何洛会已从留守在盛京的伊尔登那里了解了情况，忙说道：“伊尔登还在盛京坚守着呢。”
“真是怪了，明军怎么不进攻盛京呢？”
“我也不知道明军搞的是什么鬼。”说完，何洛会问太后：“你派人去北京向摄政王通报了吗？”
“拜音图已派人去北京了。”
“那我们还要去北京吗？”
“要不我们先去锦州观望一下，要是情况不妙的话，我们就去北京。”
路上，孝庄皇太后一边走一边担忧着盛京的安危，不断派人回盛京打听消息，可就是没有得到明军进攻盛京的消息。她自我安慰道，或许占领辽阳的明军人数太少，不敢进攻盛京。就这么着慢腾腾地经翁合走到了义州（今义县），遇到了图赖派出的尖兵。
图赖把孝庄皇太后、福临迎入锦州后，就让巴达礼率军去盛京，与留守的伊尔登汇合。
10多天后，巴达礼带着伤回到了锦州，跟他回到锦州的只有3万多人。
巴达礼一见到孝庄皇太后、拜音图、何洛会，就紧张地说道：“快，我们赶紧离开这里。”
何洛会问道：“你怎么啦？”
“他们太可怕了，简直是魔鬼。”
“你是说明军？”
“不是他们，还会有谁？”
“你到了盛京吗？”
“我到了盛京，还和他们打了几仗，没想到一下子损失了近2万人。”
“伊尔登呢？”
“没看见，估计战死了。”
“明军有多少人？”
“好像有3000人。”
“明军只有3000人，就打死了你们2万人？”
“你以为这支明军是袁崇焕、孙承宗、吴三桂那样的部队？他们邪乎着呢。”
拜音图听后，赶紧也问道：“究竟是怎么回事？”
巴达礼看了一眼拜音图，说道：“我到盛京时，明军已占领了盛京。经我侦查，占领盛京的只有3000名明军。我就想明军就这么几个人，而我有5万人马，还怕拿不下盛京？于是，我就把盛京围起来后，派兵进攻盛京，谁知他们的枪射程太远了，比孔有德的火铳射程远多了。不仅他们的枪厉害，炮也厉害，颗颗都是开花弹。我的人连护城河都靠近不了，别说靠近城墙了。攻了2天，我就损失了几千人马。我想这样下去可不行，于是我就改变战术，集中兵力进攻西门永昌门，谁知我的几万人马冲过去后，他们发射了魔鬼弹。”
拜音图已听说明军有妖术，好像是有烟雾的炮弹，还没听说“魔鬼弹”，于是问道：“什么魔鬼弹？”
“这种魔鬼弹不是在地上炸开的，而是在半空炸开的。魔鬼弹炸开后，满天都是火星，这种火星从半空落下来后，粘在身上怎么灭都灭不了，跳到河里也灭不了，直到把人烧死。火星落到地上后，到处是火，见啥烧啥，无论是人脚，还是马脚，只要踩上这种火星，人脚和马脚都会烧起来，怎么踩也踩不灭，人和马疼地在地上四处打滚，身上就粘上了更多的火星，火越烧越旺，直到把人烧得连渣滓都不剩。我一下子就损失了几万人，天知道明军是哪来的这种魔鬼弹。遇到这种武器，我还敢组织进攻吗？于是我就带他们回来了。活下来的士兵至今还心有余悸呢，整天望着天发呆，一闻到肉味就呕吐。”
何洛会听到这里，就想到了尼堪的下场，看来尼堪就是遭到了这种魔鬼弹的攻击。于是，他对孝庄皇太后说道：“尼堪也是遭到了这样的袭击。”
孝庄皇太后忙问何洛会：“尼堪怎么啦？”
“他率3000人马去天津抓朱由检，不仅没抓到朱由检，自己也战死了，只有200多人逃了回来。逃回来的士兵和巴达礼亲王说的一模一样，闻到肉味就不断地呕吐。”
孝庄皇太后心想，明军使用的是什么妖术？要是这样的话，这里所有的人还不够他们烧的，于是就问巴达礼：“你让我们离开锦州后，去哪里？”
巴达礼说道：“去北京。他们说只要我们去攻打李自成，就不会进攻我们。”
“谁说的？”
“他们的指挥官说的。我快退到四方城（今彰武）时，他们派人给我送来了一封信。”
“信呢？”
“在我怀里呢。”说着，巴达礼从怀里掏出一封信，交给了孝庄皇太后。
孝庄皇太后打开信，一看又是那个叫张罗彦的明军将领写的。信上说，明军已占领了沈阳、赫图阿拉、广宁，凭你们的实力就别想着夺回它们了。只要你们清军入关进攻李自成、张献忠，明军暂时不会攻击你们。信上同时警告清军，不得损毁在北京的明陵，不得屠sha平民，否则就掘了你们在赫图阿拉、沈阳的祖坟。
孝庄皇太后看完信后，气得浑身发抖。你们明军也太欺负人了，早不了晚不来，偏偏在我们入关，辽东空虚后来进攻。你们自己没剿灭李自成、张献忠，却让我们去替你们剿灭贼寇，我们不成了你们的傀儡了吗？还有，打仗哪有不死平民的？万一失手打死了几个平民，你们就要掘我们的祖坟，这还有天理吗？
不过，孝庄皇太后心里气归气，可仔细一想，赫图阿拉附近有努尔哈赤祖先的坟墓，盛京东郊有努尔哈赤的坟墓，盛京北郊有皇太极的坟墓。万一占领赫图阿拉、盛京的明军真掘了自家的祖坟，这可怎么办？
何洛会也问孝庄皇太后：“太后，我们怎么办？”
孝庄皇太后说道：“让我好好想一想。”
孝庄皇太后心里想道，尽管关外是大清的龙兴之地，可都是苦寒之地，每年都有4-5个月的冰封期，即使开春后也种不了多少粮食，而关内是肥沃之地，有足够的地养活大清骑兵和八旗子弟。等灭了李自成，夺得大明的半片江山后，再与明军决战。于是，她决定去北京。
孝庄皇太后在锦州冥思苦想期间，占领盛京的明军确实没有来进攻翁合、锦州。等她想出应对之策后，带着福临、拜音图、何洛会、巴达礼去了北京。
孝庄皇太后在锦州留了3000人马，监视盛京方向的动静，又在山海关留了2万兵力。
七月一日，孝庄皇太后、福临到达北京。
历史上，福临是于崇祯十七年八月二十日离开盛京，九月十九日到达北京，并于十月一日（16si4年10月30日）在北京武英殿正式登基。由于刘云龙的穿越，福临到达北京城的时间提前了50天。