圆朱市，神奇宝贝中心，小智三人看着地图，讨论接下来的路线…
小刚：" 如果要去卡吉镇的话，走这条路应该会比较快。"
小霞：" 说是这么说啦，可是我们每次都迷路。"
小智：" 没关系，迷路的话，到时候再想办法就行了。"
皮卡丘：" 皮卡～"
小霞：" 每次都这样。"
“嗡铃铃铃铃…………”
小智：" (站起)这是什么声音？"
这时，乔伊小姐和吉利蛋匆匆忙忙的从小智他们身旁走过，走到窗前眺望远处
乔伊小姐：" 这个声音是铃铛塔。"
小刚：" 铃铛塔。"
小智三人和乔伊小姐走出神奇宝贝中心
小霞：" 真的耶，是从铃铛塔的方向传来的。"
乔伊小姐：" 铃铛塔的铃铛不管遇到多么强的风吹过，都绝对不会发出声响，可是，只有在凤王过来的时候会响起，传说是这样。"
小智：" 凤王…我们去看看吧。"
随后，小智三人跑到铃铛塔，铃声停了
小智：" 铃铛的声音停了…我有不好的预感。"
小智三人跑上台阶，想要进入铃铛塔时，从塔内走出来一位穿着紫色衣服和披着白色披肩的青年拦住了他们
米那君：" 你们几位，这里是不可以进入的…"
青年话说到一半，脸就不自然地拉长了
小智：" 耿鬼！"
青年生气的甩开身后恶作剧的耿鬼
米那君：" 喂，我不是叫你去找透明铃铛吗！"
小松从塔里走了出来
小松：" 耿鬼，别在这里玩了，快去找啊。"
耿鬼飞走了
小智：" 小松，好久不见了。"
小松：" 小智，好久不见了，没有想到连你也过来了，我想，这正是凤王再临的最大征兆。"
小智：" 我觉得不可能…"
米那君：" 小松，你在说什么啊？"
小松：" 这位是真新镇的小智，他就是被凤王选中，成为彩虹勇者的少年。"
米那君：" 被凤王选中！彩虹勇者！"
青年严肃的看着小智
小松：" 我给你介绍一下，他叫做米那君，在各地做神奇宝贝传说的研究，有的时候会跑来我这里调查古代文献。"
小智：" 你好。"
随后，小松带小智等人来到圆朱道馆的藏书室，并从书架上拿出一幅卷轴
小松：" (翻开卷轴)这个就是被偷走的透明铃铛。在三百年前，凤王被人类激怒了，从此就再也没有现身，这个故事你知道吧。"
小智：" 嗯。"
小松：" 燃烧的塔中，只有四个透明铃铛跟三十二个传达凤王意志的铃铛被奇迹的留了下来，很不可思议的是，四个都没有被烧到。在重建的铃铛塔中，人们为了祈祷凤王回来，像以前的塔那样，把铃铛再挂上去，但是铃铛从来也没有响过。"
小刚：" 可是今天铃铛响了。"
小松：" 嗯。"
米那君：" 我想这次铃铛响起，是为了通知我们透明铃铛已经被人偷走了，也就是说…"
小松：" 也就是说…"
米那君：" 凤王在看着我们…不，是在看着我们的世界。"
小智：" 三百年来一直在看着吗。"
米那君：" 至少，我个人是这么认为的，传说凤王的愤怒唯有在人类与神奇宝贝之间真正心意相通的时候才会消除。"
小智：" 人类与神奇宝贝…"
小霞：" 持续了三百年的愤怒啊。"
米那君：" 但是，凤王派了三个使者到这个世界。"
小霞：" 使者？"
小智：" 就是炎帝、雷公和水君。"
米那君：" 三百年前，人们为了得到凤王的力量，互相争夺，那个影响使得铃铛塔起火燃烧，有三只神奇宝贝受到波及，来不及逃出来。凤王为了让神奇宝贝逃出，使用再生的不可思议力量，让三只神奇宝贝重生了。其中之一是北风的化身——水君，火山的化身——炎帝，以及雷电的化身——雷公。凤王祈祷人类与神奇宝贝有和平共存的一天，派这三只神奇宝贝做人类的监视者，当它们承认人类与神奇宝贝可以和平共存的时候，凤王就会再度返回。"
小刚：" 这么说，必须要三只神奇宝贝有一致的意见才行咯。"
米那君：" 就是这样。"
小智：" 我见过它们。"
米那君：" 你见过！！"
小松拿出一本古书，上面有着凤王与水君、炎帝、雷公的画像
小智：" 这个是炎帝，这个是雷公，这个是水君。"
小松：" 太厉害了，居然见过凤王和炎帝、雷公、水君，我真是太羡慕你了。"
米那君：" 我不相信！"
小智：" 可是，这是真的。"
米那君：" 我比任何人都还要了解水君，既然你敢这么说，小智，我要证实你是不是值得被水君承认的彩虹勇者的训练家，我们来比赛吧！"
小智：" 啊？"
随后，小智等人来到对战场地
小智：" 比起这个，透明铃铛更重要吧。"
米那君：" 使用的神奇宝贝为一只，没问题吧。"
小松：" 米那君，冷静一点，现在还不是比赛的时候，透明铃铛…"
米那君：" 对我来说，水君比透明铃铛更重要，你只要当好裁判就行了。"
小松：" 我知道了…真是的，一旦牵扯到水君的事，他就浑然忘我了。"
米那君：" 去吧，胡地！"
小智：" 胡地啊。"
米那君：" 我的胡地在培育的时候，受过专门对抗水君的特训，特别提高了特殊攻击力，它是与我一起追求传说，一同旅行的重要好伙伴。"
小智：" 虽然变成了奇怪的展开，但是重要的好伙伴的话，对我来说，就是皮卡丘了。"
皮卡丘：" 皮卡丘～"
小松：" 那么，胡地对皮卡丘，开始！"
小智：" 皮卡丘，十万伏特！"
皮卡丘：" 皮卡…"
就在这时，一位工作人员慌慌张张的跑了进来
工作人员A：" 小松！"
小松：" 有什么事吗？"
工作人员A：" 大事不好了，铃铛塔被好多神奇宝贝给占领了！"
小松：" 什么！"
小智等人跑出道馆，看向铃铛塔
众人：" 啊！"
小智：" 那是怎么回事？"
小刚：" 铃铛塔被…"
小智等人看到铃铛塔四周的树上都有虫系神奇宝贝，虫系神奇宝贝们吐出日丝，用白丝将铃铛塔缠绕起来，呈辐射状，向着外围侵袭而来
小霞：" 啊！是虫！"
小刚：" 线球、绿毛虫还有独角虫，这到底是怎么回事啊？"
小智：" 总之，现在不是进行神奇宝贝对战的时候，我们赶快去铃铛塔。"
众人：" 嗯。"