小智三人搭乘飞艇来到了岱柑岛…
小霞：" 内木博士的研究所在哪里啊？"
小智：" 不知道，我第一次来岱柑岛，去神奇宝贝中心问一下吧。"
随后，小智三人来到神奇宝贝中心
小霞：" 午安。"
小刚：" 橘子群岛也有乔伊小姐吗？"
小智：" 当然了。"
乔伊小姐：" 欢迎到神奇宝贝中心来。"
小刚：" 哇，太棒了太棒了…"
小刚立刻跑上前，握着乔伊小姐的手
小刚：" 太感动了，请问，你是哪个地方的乔伊小姐的亲戚？"
乔伊小姐：" 我啊，是浅红市的乔伊小姐的表妹的表妹。你们是第一次来到这座岛的吗？"
小刚：" 是啊，我们刚刚才到达这座岛。"
小霞：" 请你先把事情办完再聊好吗，小刚。"
小霞捏住小刚的耳朵，把他拽走了
小刚：" 对不起啊。"
小智：" 请问，内木博士的研究所是在哪里？"
乔伊小姐：" 内木博士的研究所啊，我告诉你，就是前面那条路，直直走到底的白色建筑物就是了。"
小智：" 好的，谢谢。"
随后，小智三人沿着乔伊小姐指的路，来到了内木研究所
小智：" 打扰了。"
小霞：" 请问有没有人啊？"
(无人应答)
小刚：" 没有人在啊。"
就在这时，皮卡丘脚下的地板突然被掀了起来，把皮卡丘弹飞了出去
小智：" 皮卡丘！"
从地下钻出来三个长相一模一样的女孩子
三胞胎A：" 你们…"
三胞胎B：" 是客人吗？"
三胞胎C：" 请问有什么事？"
小刚：" 不好意思，打扰了，请问内木博士在什么地方呢？"
三胞胎A：" 要找博士的话…"
三胞胎B：" 她在后面的海湾…"
三胞胎C：" 照顾神奇宝贝呢。"
三人：" 我们来带路。"
随后，三胞胎女孩带小智三人来到研究所后面的海湾，走了一段路程，突然从海里冒出了一只暴鲤龙
小霞：" 是暴鲤龙！"
小刚：" 那个是…"
一位穿着泳衣的女子出现在暴鲤龙身边，抚摸着暴鲤龙，接着，又从海里冒出了一只铁甲贝和蚊香蛙
内木博士：" 非常好，大家的健康都没有问题了。"
小刚：" 我也好想接受她的宠爱。"
三胞胎A：" 博士——"
三胞胎B：" 大木博士派来的人——"
三胞胎C：" 已经到了——"
内木博士骑上暴鲤龙，暴鲤龙游到岸边，内木博士从暴鲤龙身上跳下来
三胞胎A：" 博士。"
女孩扔给内木博士一件研究服，内木博士接住研究服，披在身上
内木博士：" 你们好啊，我就是内木博士。"
小智：" 好久不见了，内木博士。"
内木博士：" 是啊，没想到大木博士会派你来。"
小智：" 我对那颗神秘的精灵球感兴趣。"
随后，小智等人回到内木研究所
内木博士：" 这就是那个精灵球。"
传送装置上放着一颗上半部分为金色，有着奇怪的花纹，下半部分为银色的精灵球
小智：" 这就是…"
小霞：" 是金色跟银色组成的耶。"
小刚：" 从来就没有看过这种类型的耶。"
内木博士：" 很不可思议吧，我是偶然间得到的，以前从来都没有看过这种。"
小智：" 这上面的花纹看起来好像是英文字母。"
内木博士：" 没错，虽然不好辨认，你看，那很像英文字母的GS吧。"
小智：" 嗯。"
内木博士：" 所以我们称它为‘GS球’。"
小刚：" 听说没有办法传送。"
内木博士：" 打开传送开关吧。"
三胞胎A：" 是。"
女孩按下传送按钮，一阵白光后，GS球还在原来的位置
内木博士：" 当然，我们也试过很多了，用电锯、用铁锤、用铁棍、用线锯、用钻孔器、用镭射枪，用什么方法对付这个精灵球都没有用。"
三人：" (点头)嗯嗯。"
内木博士：" (拿起GS球)最后我想，这么特异的东西，只有神奇宝贝的大学者大木博士才能够处理，所以就请各位来了。"
内木博士把GS球递给小智
内木博士：" 来，小智，那么以后一切就拜托你了。"
小智：" (接过)是。"
而后，小智用内木研究所的通讯设备联络大木博士
大木博士：" 喂喂，我是大木。"
小智：" 大木博士。"
大木博士：" 这不是小智吗。"
小智：" 博士，现在我已经在内木博士这里了，你看。"
小智把GS球放在屏幕前
大木博士：" 那个是…"
小智：" 是GS球。"
大木博士：" GS球？"
内木博士：" 这名字是我取的。"
大木博士：" 内木啊。"
内木博士：" 好久不见了，博士。"
大木博士：" 上一次你在神奇宝贝研究月刊上面发表的‘神奇宝贝之地域差异与适应性’的中间报告写的真是太精彩了，我全都拜读过了。"
内木博士：" 哪里，博士您写的那篇‘神奇宝贝与人的共存问题探讨系列’，我也是深深的感到兴趣呢。"
小智：" 不好意思，打断一下，你们这样谈下去会没完没了的。"
内木博士：" 说的也是，对不起啊。那么，大木博士，剩下来的就拜托你了。"
大木博士：" 没问题，我尽量试试好了。"
小智：" 博士，那你就等我回去吧。"
大木博士：" 好，你可要平平安安的回来。(挂断)"
随后，内木博士带小智三人来到后院
小刚：" 这里整个地方都是庭院吗？"
内木博士：" 没错，为了正确的观察神奇宝贝的生态，必须要有这么大的地方才可以。"
小霞跑到一朵大花面前
小霞：" 不愧是南国的小岛，连花都这么鲜艳。"
这时，花动了
小刚：" 是霸王花耶。"
这时，两个女孩推着餐车跑了过来
三胞胎A：" 吃饭时间到了。"
小刚：" 是神奇宝贝的食物吗？"
内木博士：" 是啊，我们特别精心特制的。"
神奇宝贝们都跑了出来
小霞：" 哇，这里其它的神奇宝贝也跟普通的不一样耶，真是不可思议。"
小刚：" 它们是这个地方特有的品种吗？"
内木博士：" 你的没错，这也是我的研究主是之一。"
小刚：" 主题？"
小智：" 橘子群岛的神奇宝贝因为环境、气候的关系，身体的颜色或是花纹，会跟其它地区的神奇宝贝不一样。"
内木博士：" 这里呢，是距离你们居住的城市非常遥远的南方小岛，由于气候、风土环境的不同，神奇宝贝也有着微妙的差异，我就是实际在饲养，把神奇宝贝的差异记成资料的。"
小刚：" 那么，这里的神奇宝贝全都是博士你一个人饲养的吗？"
内木博士：" 没错，这些神奇宝贝都是我非常可爱的孩子呢。"
小霞：" 好棒哦，我也收服这座岛上的水系神奇宝贝回去好了。"
三胞胎A：" 这个…博士。"
内木博士看到趴在树枝上的巴大蝴
内木博士：" 又来了，真伤脑筋耶。"
小刚：" 怎么了吗？"
内木博士：" 这个孩子一直都不太吃东西耶，有改变一下配方了吗？"
三胞胎A：" 有啊，这是今天的配方表。"
女孩把配方表和神奇宝贝食物递给内木博士
内木博士：" (接过)…配方上应该是没有问题才对，到底问题是出在什么地方呢？"
小刚拿起一颗神奇宝贝食物，尝了尝
小刚：" 我知道了，我马上就回来。"
小刚找到几颗黑色的树果，把树果磨成粉末
三胞胎B：" 你在做什么？"
小刚：" 像那种按照资料，只考虑养份的食物，是根本没有办法满足神奇宝贝的。"
三胞胎A：" 啊？"
小刚：" 口味，口味啊，我们吃东西也有好吃跟难吃之分吧。"
内木博士：" 话是这么说没错，可是，你能够了解神奇宝贝喜欢的口味吗？"
小刚：" 这个你等一下看了就知道了，好，完成了。"
小刚把粉末洒在神奇宝贝食物上面，巴大蝴飞了下来，快速的吃着神奇宝贝食物
三胞胎B：" 哇，好厉害哦。"
内木博士：" 真的是这样耶。"
小刚：" 巴大蝴喜欢吃比较甜的东西，所以呢，我就把，带有甜味的树果多掺杂了一些进去。"
内木博士：" 看你这样，我实在有点惭愧，身为研究者，我却没有像你那样的替神奇宝贝着想。"
小智：" 术有术攻，小刚是以成为世界第一的神奇宝贝饲育家为目标的。"
小刚：" (不好意思)哈哈…"
内木博士：" 想当饲育家啊。"
三胞胎A：" 请你也教我们神奇宝贝喜欢的味道好不好，拜托嘛。"
三胞胎B：" 真的拜托你了啦。"
三胞胎C：" 顺便请问你一个问题，该不会你对人也…"
小刚：" 人？"
小智等人来到研究所的客厅，看到客厅里面堆满了垃圾，厨房里堆满了没洗的碗盘，卫生间里堆满了没洗的衣服…
小霞：" 好脏哦…"
内木博士：" 没关系的啦，我们除了研究之外，对别的事情完全没有兴趣，其他的事情嘛…"
三人：" 随便做就了事。"
小智：" 不是这个问题，更何况这也太…"
小刚：" 呵呵呵，打扫、洗衣服、扫除丢垃圾，好久没有机会大展身手了。"
小刚系好围裙，拿出打扫工具
小刚：" 这一切就全部包在我的身上吧。"
小刚快速的一边打扫卫生，一边做晚餐…
内木博士：" 小刚这个人…"
三胞胎A：" 好像…"
三胞胎B：" 非常的…"
三胞胎C：" 厉害耶。"
小霞：" 乐在其中了。"
小智：" 这是他的兴趣。"
皮卡丘：" 皮卡皮卡～"
小刚打扫好卫生，晚餐也做好了…
内木博士：" 那么就快点…"
三人：" 我们开动了。"
小智：" …大家的吃相好惊人啊。"
小刚：" 善哉善哉。"
深夜，内木博士、三胞胎女孩和小智蹲在灌木丛后面，观察霸王花的夜间活动，小刚送宵夜，就在这时，一只拉达跑了出来，沾染到了霸王花的麻痹粉，小智还没来得及行动，内木博士就冲了上，保护拉达，但也使自己沾到了麻痹粉，小智等人连忙把内木博士和拉达送到神奇宝贝中心，乔伊小姐批评了内木博士，并替内木博士和拉达治疗。第二天早上，小刚正在修理研究所的屋顶
内木博士：" 小刚他说，他要留下来帮我们大家的忙。"
小霞：" 啊！"
小刚：" 行了，这下子漏雨的问题就解决了。"
内木博士：" 小刚，谢谢你了。"
三胞胎A：" 太好了。"
三胞胎B：" 果然有男人在就是不一样耶，博士。"
内木博士：" 是啊。"
小智：" 小刚，这是怎么回事？"
小刚：" 你去问问南风吧。"
小智：" 哈？"
小刚沿着梯子，从屋顶爬下来
小刚：" 留在这个地方，好像可以看到很多神奇宝贝的新面貌，身为训练家以及饲育家，这个地方特别激起我的兴趣。"
小智：" 是吗，那么，再见了。"
小刚：" 你也要加油哦，小智。"
小智：" 好。"