晋献公当国的第十六年，在灭掉耿、霍、魏三国并赐地给赵夙、毕万的同时，还为太子申生修建了曲沃的城池，而太子申生此前已被任命为下军统帅，按晋国的制度，担任这一职位者就是卿。
有先见之明的士蒍这时就看出了不好的苗头：“国君不想让太子继承君位了！把都城封给他，又给他卿的官位，先让他达到了官位的顶点，还怎能被立为国君呢？”
士蒍为太子申生设想的出路是：“不如逃走，不要在这里等着受陷害，让罪名落到头上来。做个吴太伯，不也可以吗？这样还可以保有好名声，胜于留在晋国遭祸。如果上天保佑太子，他就不会再待在晋国！”
士蒍所提到的吴太伯，就是《在春秋战国之前》中讲过的，周文王的祖父周族首领古公亶父的大老婆生的大儿子，也就是周文王的大伯父。按照宗法制度，吴太伯是不容争议的继承人。但是，古公亶父却特别看重孙子姬昌（周文王），想让他继承部族首领之位。可姬昌是古公亶父的三儿子季历的儿子，除非立季历为继承人，否则姬昌绝无可能当上部族首领。可是立三儿子季历又不合立长不立贤的规矩，古公亶父既不想开破坏规矩的先例，又想抛弃规矩而立贤，左右为难。从这也可以看出宗法制度有多么脆弱，刚创立不久就几乎坚持不住了，你叫后代子孙如何能守得住？再说了，假如这次守住了这个制度，那么也就没有了什么周文王、周武王，甚至是否会有周王朝都难说！季历的两个哥哥太伯和仲雍看出了父亲的心思，就主动逃亡到南方蛮夷之地去了，这样季历就当上了首领。周王朝建立后，为了报答太伯仲雍，到处寻访太伯、仲雍的子孙，结果发现，太伯并无子孙，仲雍倒有很多子孙，他们已成立了一国家吴国，于是周王朝就把仲雍的一个后代封在吴国，让他继太伯的香火，另一个仲雍后代则继仲雍的香火，封在虞国（已被晋献公灭掉），太伯因此也被称为吴太伯。
以上是史书上说的，很怀疑太伯和仲雍的流放真的是完全出于自愿，他们的父亲真的一点没有向他们施加压力？总之，如果要立贤，又不想破坏宗法制度，就要嫡长子高度自觉，主动流亡或自杀。如果不自觉，那么就有可能会发生非常不愉快的事情，比如谋杀，比如冤案之类。——这是题外话了。
反正士蒍的意思就是希望太子申生自我流放，离开这是非之地，别在晋国等死。为什么？申生到底碰到什么麻烦了？事情还得从晋献公的女人说起——
首先，太子申生虽是长子却不是嫡长子，他母亲不是晋献公的大老婆。晋献公的夫人是贾国国君的女儿，贾国是个姬姓的侯爵级诸侯国，后来也是被晋国灭掉的。国君夫人通常也被尊称为“少君”，贾少君，简称为“贾君”，她没能生出儿子来。晋献公又把父亲晋武公的一个小老婆齐姜搞上了手，居然生了一子一女，女儿长大后嫁给了秦国国君秦穆公，成为秦穆夫人，儿子就是申生！
跟卫宣公一样，晋献公一开始也是对自己这个小妈非常宠爱，连带着对她所生的儿子也宠爱，就立申生为太子。后来，有了别的女人，嫌弃小妈了，连带着她生的儿子也嫌弃，就要换太子，完全是一样的套路。
跟小妈生了两个孩子之后，晋献公又从戎国娶了两个夫人，是一对姐妹花。不过，这对姐妹花却不是少数民族的戎族，而是华夏族，且跟晋献公是同一祖宗，是晋国的开国国君唐叔的另一支子孙，一直生活在戎狄生活区的，也姓姬，以狐为氏。所以姐姐就被称为大戎狐姬，妹妹被称为小戎子。另有一种说法，说两人并非姐妹，小戎子为允姓的戎人。而《史记》则说这对姐妹花不是戎国的，而是翟国的，“重耳母，翟之狐氏女也，夷吾母，重耳母之女弟也”，翟就是狄，到底是戎还是狄说不清了，估计那里是戎人狄人混居地区，中原人也分不清他们到底是戎还是狄，这个不重要，反正这对姐妹花既非戎又非狄，是华夏族人，只是来自戎狄生活区而已，不过，很可能已混杂了戎狄的血统。如前所述，这对姐妹花中的姐姐大戎狐姬生了儿子姬重耳，妹妹小戎子生了姬夷吾。
晋献公即位的第五年，他率军攻打骊戎，这也是一个生活在戎人生活圈的华夏人诸侯国，而且也是姬姓，是男爵国，他们的地盘在今陕西临潼东。骊戎国打不过晋国，国君就献出两个女儿以求和，就是骊姬和她的妹妹。
晋献公一得到这对姐妹花就喜爱得像老鼠遇上了大米，当即就要立骊姬为夫人。请占卜的人来占卜，占卜的结果是，不吉利。晋献公不死心，又叫占筮——用蓍草起卦，然后根据卦象和《易经》上的卦辞来判断吉凶。结果倒是吉利。晋献公说：“按占筮的结果办！”
占卜的人说：“占筮没有占卜灵验，不如按灵验的办，而且占卜的繇辞上说，‘专宠她会生出变乱，将夺去您的美事，把香草臭草放在一起，过了十年还有臭气。’所以，一定不能立她为夫人！”
晋献公不听，硬是立骊姬为夫人。后来骊姬生了儿子姬奚齐，她妹妹生了儿子姬卓子。
骊姬不仅生得美而且头脑很管用，晋献公被她迷得神颠魂倒。她一心想把自己的儿子奚齐立为太子，就贿赂晋献公的两位宠臣梁五和东关五，让他们劝说晋献公把三个大儿子都打发出国都。
晋献公真的就让太子申生住到了曲沃，让重耳住到蒲，让夷吾住到二屈，蒲和二屈本来都是狄人的地方，现在都已并入晋国版图了，不过也都属于晋的边境地带。
后来，其他儿子也都被陆续打发到了边邑，只有骊姬和她妹妹的儿子留在了国都绛城，父母的身边。
接着，晋献公命太子申生带兵去攻打赤狄的东山皋落氏部落（在今山西垣曲西北）。
大夫里克劝谏说：“太子是奉事宗庙大祭、社稷祭祀和早晚照看国君饮食的人，所以被称为冢子。国君外出，太子守护国家，如果有别人守护国家，太子就跟随国君一起出去。跟随国君一起出去，叫做抚军，留下守护国家叫做监国，这是古代的制度。领兵征伐，不是太子的事情啊。”
晋献公说：“我有好几个儿子，还不知道立谁为继承人呢！”
里克无语了，退了下去。他又去进见太子申生，太子申生忐忑不安地问他：“我大概就要被废掉了吧？”
里克说：“您应该担心能不能很好地完成任务，而不要担心会不会被废，修养自己的品德，不责怨别人就能免去祸难。”
等到太子出征之时，晋献公却让他穿上一种奇怪的衣服，左右两边不同颜色，一半是原先太子服装的颜色，另一半则是国君的公服的颜色，还让他佩戴了用金制成的玦。
大夫狐突为太子驾驭战车，另一位大夫先友担任太子的车右。先友高兴地对太子说：“穿着国君衣服的一半，掌握着军事的机要，成功在此一行了，请您勉励啊！国君分出衣服的一半给您，没有恶意，您又兵权在手，可以远离灾祸，看来国君是信任和亲近您的，您还需要忧虑什么呢？”
狐突的看法却跟先友相反，他叹息说：“时令，是事情的征象；衣服，是身份的标志；佩饰，是心意的旗帜。如果国君真的信任亲近太子，就应该在一年的开始之时命他出征，穿在他身上的也应该是纯一色的衣服，佩饰也应该是合乎礼制的玉玦！而在眼下这个年终之时命他出征，那是国君想让太子办不成这事；让他穿这杂色衣服，是要疏远他；让他佩带金玦，那是要丢弃他，金象征着寒冷和肃杀，玦意味着决绝，国君分明是要抛弃太子啊！”
大夫罕夷担任这次出征部队的下军卿（下军统帅），他赞同狐突的看法，说：“国君已经有害太子的心了。”
大夫先丹木担任罕夷的车右，他也持同样的看法，他对太子说：“这样的杂色衣服，狂人也不会穿它！而且国君的命令是‘杀尽了敌人再回来’，狄人那么多，能杀得尽吗？就算杀尽了也不能万事大吉，宫内还会有谗言来害您，不如逃走吧！”
大夫羊舌突这次担任军尉（军中执法官），他反对说：“不行，违背父命是不孝；抛弃国事是不忠。虽然知道国君对您不怀好心思，但不忠不孝的罪名也不可接受，您还是为此而死吧！”
还好，太子申生这次总算完成了任务，晋献公没有得到杀申生的理由。
晋献公二十二年，骊姬跟中大夫里克串通，商量好了除掉太子的办法。
这年的十二月，骊姬对太子申生说：“国君梦见了你已故的母亲齐姜，你赶紧去祭祀她。”
申生马上回到曲沃他的住地去祭祀母亲，祭祀完毕，按照规矩，得把祭祀时所用的祭肉和酒拿来献给献公。申生送祭肉祭酒来时，晋献公正在外面打猎，骊姬就把祭肉祭酒收下放在宫中，乘机在里面下了毒。
六天以后，晋献公回宫了，骊姬把祭肉祭酒给献公。献公在吃肉喝酒之前，按老规矩，先要往地上倒一点酒，敬地神。结果，酒一入地，地上的土就鼓了起来。晋献公大惊，马上拿些祭肉给狗吃，狗立即被毒死。再给小臣吃，小臣也立刻中毒而死。
骊姬哭着说：“这祭肉祭酒都是太子献给您的呀！”
太子申生听到消息，逃回了他所住的曲沃新城。
申生的老师是大夫杜原款，他听到申生被诬陷的消息后，非常自责，觉得自己这个老师没有教导保护好学生，而且知道自己也难逃一死了，学生有罪，老师也要连带受惩罚，就叫人带口信给申生，说：“这是我太无知了，平时没去打听情况，又不敏感，不能及时教导你防范阴谋，才发生了现在这样的悲剧。这都怪我没有揣测国君的心意，没有早早提醒你丢弃太子的身份逃亡到别国隐居起来。唉，能早提防的话就不会遭到如此悲惨的下场了！”
晋献公没抓到太子，就把太子的老师杜原款杀了。
太子身边的人对太子说：“您应该申辩，国君对这件事一定会弄清楚的。”
其实申辩有屁用！晋献公那么精明能干的人，能看不透骊姬的伎俩？知子莫如父，申生是多么厚道的一个孩子，晋献公会一点不知道？他完全是配合着骊姬在演戏嘛！
太子说：“我若申辩，骊姬肯定有罪，这肯定是她干的。可是，如果骊姬被处死，国君没有骊姬就会寝食不安，他年纪大了，我不想使他不快乐。”
“既然这样，那您赶紧逃走吧。”
“国君还没查清这件事，我若逃走，身上就带着谋害君父的罪名，带着这罪名，谁会接纳我呀！”
于是，太子申生就在曲沃新城的住所里上吊自杀了。
骊姬又对晋献公说：“重耳和夷吾两位公子是太子的同谋，他们都知道太子谋害您的阴谋。”
此时已是年底，重耳和夷吾也都来国都绛城了，应该是来参加年底的祭祖仪式的。听到消息，重耳忙逃回了蒲城，夷吾也溜回了屈城。
晋献公派寺人（国君身边受过阉割的侍者，即后世所谓“太监”）披带兵去攻打蒲城。
重耳说：“君父的命令不可违抗。”他遍告蒲城的民众和守军，不许抵抗国君的军队，“谁抵抗谁就是我的仇人！”说完就跳墙逃走。
就在这时，寺人披已赶到，左手一把抓住了重耳的一只衣袖，右手挥刀便砍，没砍到重耳，倒把那只袖子砍断了。
重耳逃出蒲城，直奔翟国他姥姥家而去。
第二年春天，晋献公又命大夫贾华率军攻打屈城。
当初，士蒍奉命为重耳和夷吾筑蒲城和屈城时，工作态度极不端真。这时的城墙都是夯土的，筑城的土里掺了许多柴草，会影响到城墙的坚固，他也不管。夷吾见了就向父亲投诉。晋献公派人责备士蒍，士蒍叩头回答说：“国君命令我来筑城，我若不来就是不敬。但是，三年以后国君就要到这里用兵，攻打这个城子，我干嘛把它筑得那么坚固？”他还郁闷地赋了首诗：“狐裘蓬松，一国三公，我将跟谁？”
现在贾华带着军队来攻城了，夷吾知道这城守不住，就跟城里的人举行了一次盟会，让他们宣誓决不背叛他，然后他就逃走了。他也想逃往外婆家翟国，他的亲信属下卻芮提醒他：“公子在重耳之后逃走，却跟重耳逃去相同的地方，这就显得好像你们俩果然是在一起阴谋串通的，您的谋害君父的诬谄就会被坐实了。不如去梁国吧，梁国靠近秦国，而且秦国也信任梁国，一旦晋国有变，有利于您将来借助秦国之力回来。”于是去了梁国。
公元前651年，晋献公病重。他召见了奚齐的老师荀息，指着奚齐说：“我这弱小的孤儿，要委屈大夫您保护了，您看怎么样呢？”
荀息叩头回答道：“臣愿意竭尽全力，再加上臣的忠贞之心。若能成功地保全他，这是靠您在天的威灵庇佑；若不成，臣就以死继之！”
九月，晋献公死了。骊姬的儿子奚齐继位。
大夫里克、丕郑马上策动申生、重耳、夷吾的拥护者起来作乱，他们想把局势搞乱，然后乘机迎接重耳回来继位。
里克找到荀息，对他说：“申生、重耳、夷吾三位公子的支持者马上就要起来作乱了，秦国人和晋国人都支持他们，您打算怎么办？”
荀息说：“我会为保护奚齐而死。”
“这样做有什么意义？”
“我答应先君的，不能改变。”
按照礼制，办丧期间，已故国君的继承人必须身穿粗麻布衣服，住在为办丧而专门搭建的茅草屋里。这年十月，里克在奚齐居丧的茅草屋里把奚齐杀掉了。
荀息得到消息，就要自杀。有人劝他说：“不如立骊姬妹妹的儿子卓子为君，您再辅佐他。”
荀息就真的立卓子为君，然后安葬了晋献公。
十一月，里克又在朝堂上杀了卓子。荀息自杀。