小智的橘子联盟之旅还没结束，花子怕小智在惹出什么事端家里反正有魔墙人偶在，于是花子就代替小健陪小智留在了橘子群岛旅行。
小健则是跟着大木博士以及难得团聚的日奈一家回去真新镇了。
宗次打算留在亚西亚岛再多了解一下关于传说的事，边和几人分手了。
在通讯船上
“你这两年又跑到哪里去鬼混了啊？！”时子揪住了詹森的耳朵
“疼疼疼~时子~你饶了我吧~我没有鬼混~我只是去追求理想而已~”詹森
“追求理想就可以两年不回家吗？！”时子
“我有寄明信片回家不是吗~”詹森
“明信片是明信片！人是人！再说了！你的手机难到是摆设吗？！”时子
“我一直没敢和你说...”詹森默默的拿出了自己的手机碎片“它在很久之前就坏掉了...”
“手机坏了！你不会再买一个吗？！”时子
“可是~就算我再买一个~也可能会坏掉不是吗~”詹森怼了怼手指“所以我就想啊~干脆不要用手机好了~”
“那洛托姆呢？”时子
“洛托姆当然好好的啊~”詹森拿出了一个宝贝球“它就在这个宝贝球里面~”
“真是的！你们父女两个一个样！”时子
“妈妈~我又怎么了~干嘛连我也骂啊~”日奈
“你说呢~”时子
日奈这才想起来自己的手机也是前段时间刚换的“对不起...”
“话说那个叫可可孩子是怎么回事？”詹森
“你就把他当作是你儿子好了~”时子
“儿子？！”詹森和日奈
“是啊，可可的父母在10年前就过世了，他是被宝可梦养大的。你不觉得很可怜吗？！你也想给他一个温暖的家对吧！”时子
“的确...”詹森眼泪汪汪“好！从今天开始我就是他的爸爸了！不管别人说什么我都是他爸爸！”
“对对对~就是要这样才对~日奈~你以后要和弟弟好好相处哦~”时子
“是~”日奈
第二天众人就回到了关都地区的枯叶市
时子看着海里密密麻麻的玛瑙水母“原来枯叶市的码头也有玛瑙水母啊~”
日奈带着波克比和可可去和玛瑙水母们亲密接触了
“软绵绵的对不对~波克比~”日奈
“jaki~duyi~”摸着玛瑙水母的波克比
“是珍惜画面！拍照的好机会！”詹森举起了相机，然后就看到了远处的水花“那是什么啊？巨牙鲨吗？”
“应该不可能吧~这里可是关都~”时子
这时那个水花的制造者来到了岸边
“波加！”是一只已经瘦到脱相的波加曼
“波加曼？！”众人
“企鹅宝可梦！是我的菜！就是瘦了点！不过没关系！”时子拿出了宝贝球“去吧！宝贝球！”
可是时子丢出的宝贝球被那只波加曼打了回去
“没想到你还挺顽固的嘛！很好！那就来对战吧！”时子刚打算派出宝可梦
“等一下！”日奈拦到了波加曼面前“妈妈，你不觉得波加曼出现在这里很奇怪吗？”
“对哎~为什么波加曼会出现在这里啊？”时子
于是众人就将这种已经瘦到脱相的波加曼带到了对任何消息都能很快知道的樱木博士的研究所