本堂瑛佑一直在接近毛利家，希望借这位名声很大的“沉睡的小五郎”的人脉打听，与他姐姐长得几乎一模一样的水无怜奈的消息。
不知道为什么，原本一直在日迈电视台当主播的这位水无怜奈小姐，如同突然消失了一样，他有试着去电视台询问，得到的答案是她自己提的离职。
但是作为电视台主播的她，竟然没有再在任何一个电视台中出现过。
他想要知道水无怜奈到底是不是他的姐姐，本堂瑛海，如果是的话，为什么改名了，这几年完全失去联系的姐姐。
在他一次次引导毛利小五郎回想是否有接过关于突然消失的名人的委托时，都被一个叫柯南的小孩打断了。
这个小孩，不同寻常的聪明，完全不像是一个普通的7岁小学生。
明明不住在毛利侦探家，却天天往他们家跑，而且那么小的孩子，好似对小兰有不一样的感情。
柯南在跑到毛利家，遇到了那个长得非常像黑衣组织那个“基尔酒”的少年，他总是有意无意的问毛利大叔，想从毛利大叔探查关于那个消失的女主播，水无怜奈的消息。
加上本堂瑛佑与水无怜奈相同手法的测谎姿势，令柯南一度怀疑本堂瑛佑也与黑衣组织有关系，他如临大敌。
后来不断的接触与本堂瑛佑不断探索下，柯南也在悄悄观察和搜集相关情报，他将本堂瑛佑的照片传给了服部，让他帮忙调查，服部的爸爸是大阪府警本部长，在服部的帮助下倒是查到本堂瑛佑爸爸的消息。
他求了博士好久，才带他去找了一个有本堂瑛佑爸爸照片的人家中，得到他受雇于PANY的消息，别人都以为他是普通的公司职员，但是柯南知道，PANY指的是CIA，阿美莉卡的谍报组织。
他有一个不太成熟又非常想去证实的想法，也许水无怜奈是——007小姐，也不一定。
所以当时他跑去捡鞋子时，问他是不是在跟踪她，明明已经发现他在撒谎，却没有继续追究，他也没有受到任何暗部势力的监视和追杀。
本堂瑛佑一直给电视台打电话询问水无怜奈的消息，他还是想要知道水无怜奈为什么消失了，她到底是不是他姐姐。
柯南没有了FBI的助力，没有了相关的情报来源，他查证进度非常缓慢，仅仅只能猜测，如果水无怜奈是本堂瑛佑的姐姐的话，那么她很有可能是CIA潜入黑衣组织的卧底。
在他和本堂瑛佑一起去过水无怜奈的超级粉丝的家里，拜托他给他们看水无怜奈以前的录像带，并让他看过了本堂瑛佑的姐姐的照片，粉丝说这是水无怜奈。
但是水无怜奈是AB型血，而本堂瑛佑是O型血，他记得自己小时候被姐姐输过血，O型血可以给别人输血，但是也只能接受O型血，所以本堂瑛佑判定水无怜奈不是他姐姐。
（假的，亲兄弟姐妹，直系亲属之间是不建议输血的，容易产生非常严重的并发症，73老贼不知道怎么回事。）
而本堂瑛佑则怀疑水无怜奈应该是某个危险组织里的人，将自己整容成她姐姐的模样，以达到什么目的。
而柯南的调查也在这里止步了。
他虽然答应了老爸不再追查组织，但是每次都像是送上门一样，出现一点点和组织相关的信息，他实在是很难忍住不去探寻。
本堂瑛佑虽然得知水无怜奈不是他姐姐，但是依旧没有放弃寻找水无怜奈以及自己的姐姐，却突然被FBI找上门，FBI的人为他申请了证人保护计划。
他拒绝了，虽然并不清楚为什么FBI会突然找上他。
柯南同他说了，他爸爸有可能是CIA的谍报人员，他决定要去阿美莉卡留学，未来也要加入CIA，去探寻爸爸和姐姐的踪迹。
乌丸垣回霓虹的时候，本堂瑛佑已经去了阿美莉卡，他这边目前仅知道本堂瑛佑去毛利事务所应该是想找水无怜奈，但是绝对没找到就是了，水无怜奈那会还待在大冈雄弘那里当秘书呢。
乌丸垣在离开大冈宅邸后，就回家了，为文太上传了身份信息登记。
地下训练室。
乌丸垣给文太做了皮套，黑色碎发两鬓是红色挑染，瞳孔是红色，长相可爱带着帅气，可以说和文太自身风格类似，马甲是Jyugo。
“这都是谁啊？你到底都是哪里见过的这些人？”仁王幻影成了之前他自己选的离人巴赫的模样，指着自己的白色狼尾和红瞳，手指扫了一圈他们。
已经幻化成一方通行的乌丸垣，手里捏着自己马甲皮套的幸村（垣根帝督），柳生（折木奉太郎），文太（Jyugo）几人，“我想象力丰富，天才的思维你是无法理解的。”
放下皮套，乌丸垣再次开始了几人的体术教学，没力气了充电继续练，打骨折了治疗继续练。
......
波本那边回到霓虹便重新去咖啡店打工，并尝试接近毛利小五郎，出了点学杂费，以拜他为师的理由时常接近他们，当然学杂费是找组织报销的。
毕竟他是发觉毛利小五郎不太对劲，平时迷糊的模样和破案时都陷入沉睡的样子，非常可疑，为了组织收集情报才产生的学杂费，当然要报销了。
他离开霓虹这么长时间没有和他在公安的属下风见裕也联系，风间一直尝试联系他，他找了组织怀疑他是卧底，近期被盯的很紧的借口，才不与他联系。
普拉米亚那个疯子果然没再纠缠他，他偶尔也会做点公安身份该做的事，逮捕一下逃窜的罪犯什么的，毕竟，他可是警校出来的降谷零啊，公安身份可得好好维持一下。
他在毛利小五郎身边发现了一个有趣的小孩，名字居然叫江户川柯南，是个逻辑思维，推理能力都非常不错的小孩。
“柯南小弟弟真是不像一般小孩呢。”波本俯下身笑眯眯地为几人端上咖啡和三明治，柯南摸着大脑袋笑的可爱，“呵呵，因为我平时就很喜欢看推理啦~”
“柯南未来长大也要当侦探吗？像毛利师父这样的‘名侦探’。”波本张嘴就是恭维，哄得毛利小五郎得意不已。
“额呵呵...是啊。”侦探肯定要当的，不过才不是毛利大叔那种糊涂侦探。
说起来侦探这个职业，人数真是不少呢，不过谁让这里总是发生凶杀案。
前段时间新闻大肆报道的前首相大冈雄弘在家中被人鲨害，还找了许多侦探前去破案，一直到现在都没有找到任何线索呢。
宅子的走廊装了不少的监控，没有拍摄到任何人进入冥想室，除了受害者本人和一起进入查看情况的两名保镖。
不知道怎么的，他突然想到那群网球少年，如果是他们的话，会有人可以做到神不知鬼不觉的进入吗？
基尔那个家伙这段时间居然一直在那个前首相身边，难怪没有在电视播报中以及组织任务时见过她的身影。
虽然平时他跟组织成员见面的机会也不多，不过偶尔还是会在任务中有协作或酒吧碰面的。
所以这个事，是组织做的吗？