虫子们已经陷入了绝境，这时，天上的乌云终于爆发了，瓢泼大雨下了下来，瞬间扭转了这一切。
越战越勇的青蛙被雨一淋，也没了气势，他脚下一滑，跌进了大海里，苍蝇船长连忙扔下一根绳子，想救大青蛙。但大青蛙太重了，还差点把苍蝇船长拽进海里。
“青蛙兄！青蛙兄！”苍蝇船长哭着喊道。
“我要让你们付出代价！”苍蝇船长大喊道。
这场大雨也浇灭了火柴的火，救了烽火台里的红蜘蛛。虫子们愤怒地展开了反击！它们毫不畏惧地捡起身边的石头，用力扔向那些嚣张跋扈的蚊子水手们。石头如雨点般落下，有些蚊子被直接击中，惨叫着坠落；而有些则幸运地躲过一劫，但也被吓得惊慌失措。
与此同时，另一群聪明的虫子将大量的胶水涂抹在树叶上，并巧妙地将其抛向海盗船。这些胶水仿佛具有神奇的魔力，一旦接触到船体和海盗们，就会迅速黏附上去，让他们无法挣脱。一时间，一大群海盗被困在了胶水中，苦苦挣扎却无济于事。他们的翅膀被粘着，身体变得沉重无比，原本威风凛凛的气势瞬间荡然无存。
蚊子们乱作一团，苍蝇船长试图让大家保持冷静，但收效甚微。
这时，漂流瓶里的虫子朝苍蝇船长扔出了几块石头，苍蝇船长左飞右飞，他汗流浃背了。
苍蝇船长飞到了海盗船上，对着困惑的蚊子们大喊：“伙计们，我们不能让这些可恶的虫子们得逞！跟我一起战斗！”
受到苍蝇船长的鼓舞，一些勇敢的蚊子开始响应，它们展翅高飞，准备迎接虫子们的攻击。
虫子们看到蚊子们并没有放弃，于是更加勇猛地投入战斗。它们用各种方法攻击蚊子，有的用黏液，有的用毒刺，还有的用锋利的牙齿。
战斗进入白热化阶段，双方都不甘示弱。然而，就在这时，一道闪电划破天空，紧接着是一声巨响——雷响了。
雷声震耳欲聋，海盗船在风中摇摇欲坠。蚊子们惊恐万分，纷纷四处逃窜。
虫子们趁机发起最后一击，它们团结一心，将海盗船彻底摧毁。
随着海盗船的摧毁，这场激烈的战斗终于画上了句号。虫子们欢呼雀跃，庆祝着他们的胜利。尽管疲惫不堪，但他们知道，这场战斗让他们更加坚强，也让他们明白了团结的力量。
可是，这时，几滴雨水滴在了海盗船的废墟上，胶水失去了粘性，苍蝇船长和三只蚊子飞了起来，他们冲向了毫无还手之力的小蝴蝶，把她绑了起来。
苍蝇船长哈哈大笑，说：“再见了，小虫子们。”接着，他们往北方飞去。
“正北方，难道是…海盗之巢！”小蚂蚁惊叫道。海盗之巢是苍蝇船长的终极巢穴，据说里面有各种武器，特别危险，看来，虫子们遇到有史以来的最大灾难了，因为，他们惹怒了苍蝇船长。