在发觉有组织的人接近，又偷听到柯南跟服部平次说有人去警视厅盗窃了毛利小五郎的相关卷宗后，灰原哀便把消息告知了神代伊生。
如果组织发现了她的身份，她要么会被抓回组织，要么会被杀掉，而只要神代伊生还想要她的科研能力，就要帮忙解决掉即将要调查到她身上的组织成员。
灰原哀也担忧神代伊生会不会因此用要保护她的理由，要求她离开阿笠博士的住所，搬到他掌控的地盘上，实施表面上的保护实则跟组织一样的监禁行为，但是神代伊生并没有提出这种要求。
可是神代伊生在收到消息后也没有告诉她会怎么应对组织的人，只说自己知道了，让她不用担心，只要她不主动涉险就不会有事。
灰原哀对于神代伊生的话半信半疑，虽然她不清楚神代伊生的真实实力，但是神代伊生会这么说显然是足够自信的，只是她会听话躲避危险，柯南却是会主动迎着危险找过去的人。
她是知道柯南联系了服部平次一起去调查了，他们调查到了什么她并不清楚，他们看样子也没打算告诉她，她不生气，毕竟她也没有跟柯南说过神代伊生的事情，就连组织的情报都没有向柯南透露过多少。
他们互相都默契地没有探究彼此的秘密，但灰原哀不会允许柯南承担自己引来的危险去冒险。
灰原哀最近突然发起了高烧，前不久在昏睡间朦胧感觉到了贝尔摩德的气息，醒后从阿笠博士和柯南得知了新出医生和朱蒂老师来阿笠博士家里照顾她，由于灰原哀在最初发烧时拒绝去嘉纳医院，阿笠博士和柯南就没有联系神代伊生，但后来找不到合适的医生，他们又联系上了麻生诚实，新出医生是之后听闻了灰原哀生病的事情就主动找上门说可以帮忙的，那时候麻生诚实还没到，灰原哀又高烧昏迷过去了，他们便让新出医生先帮忙看看了。
即便灰原哀和柯南没有讨论过，以他们的智商也察觉到了新出医生和朱蒂老师的异常，只不过灰原哀没想到柯南会趁她睡着把她锁在了地下室，自己伪装成她的模样去赴贝尔摩德的邀约。
在睡醒过来找不到柯南和阿笠博士后，灰原哀大致明白柯南的计划，当即就坐不住了，翻找出了她早就藏了起来的备用眼镜，根据眼镜片上显示的位置就找了过去，同时赶紧联系上神代伊生告知情况。
神代伊生回复的消息令她稍稍松了口气又不能完全放下心来。
“我就在现场看着呢。”
这句回复好像在说现在的发展都在神代伊生的意料之中，令灰原哀感到有种被操控的不适，不过这样也说明柯南的人身安全应该有了最低保障。
虽说灰原哀感觉神代伊生并不怎么在意他人的生死，但是以柯南是极少数的A药幸存者之一的身份，神代伊生大概也不太可能放任柯南去送死。
灰原哀的猜想在自己踏入码头后逐渐变得不确信起来了。
神代伊生说自己就在现场，可他人呢？
灰原哀快速地扫视了一圈四周，一边是一览无余的大海，另一边是堆叠成山的集装箱，那里没有光线照耀，就连月光也吝啬着自己的目光，灰原哀无法确认神代伊生是否就在集装箱的阴影中。
中央是宽阔的道路，两辆汽车车头相对，灰原哀隔着十几米远就看到了那几个人影，里面并没有神代伊生。
在她坐出租车赶来的路上，神代伊生就曾告诉过她可以回阿笠博士家去，不用担心柯南的安危，可是灰原哀终究放心不下，还是来了。
贝尔摩德针对的是她，与柯南并没有关系，灰原哀不想柯南因为她的缘故而受伤甚至死亡。
工藤新一会变小成柯南是她所制作的药物导致的，本就是被她所牵连，灰原哀不能接受柯南这次又代替她去冒险。
只是现场的情况出乎了她的意料，同时她的到来也出乎了柯南的意料。
灰原哀没想到自己到场后看到的是柯南与贝尔摩德相互对峙，而一直表现得十分神秘的朱蒂老师此刻却跌坐在车子旁，看起来还受了重伤。
柯南在见到她后变换的神情中隐隐流露出几分焦急，灰原哀对贝尔摩德也有些了解，知道这如果是贝尔摩德谋划出的舞台，那么现场绝不可能只有贝尔摩德一个人，她必定还会找帮手，她没看到那个人的身影就说明对方不在她的正常视距中，结合朱蒂老师受的伤，对方极有可能是一名狙击手。
灰原哀额上不禁沁出了几滴冷汗，呼吸都急促了几分，她意识到了自己行为的鲁莽，但她走向贝尔摩德所在方向的脚步却没有停滞，柯南见状更是大喊出声让她快跑。
趁着柯南转头吼灰原哀分神，贝尔摩德抓准了机会猛地上前一手抓住了柯南戴着手表的手臂，另一只手迅速转动着手表的表带，表盘的准心彻底从贝尔摩德的身上移开了。
柯南立即奋力挣扎起来，可是小孩子的力气相较于成年人的力量相差太多了，柯南完全挣脱不开贝尔摩德的控制，最靠近他们的朱蒂还身负重伤，即使再焦急也帮不上半点忙。
灰原哀离他们还有几米的距离，见到贝尔摩德的动作有些呆愣住了，还没来得及反应，贝尔摩尔便把转动了方向的表盘对向了柯南自己，然后按下了手表侧边的按键，向柯南发射了麻醉针。
麻醉针生效的极快，被麻醉针扎多有了抗性的毛利小五郎还能有一两秒的时间找座位，但是柯南的体量小，眼皮顿时卸了力气往下落，柯南不甘地试图抵抗，又怎么能抵抗得住麻醉针的药效。
他原本用来对付贝尔摩德的武器最终落到了自己的身上。
贝尔摩德轻柔地把晕过去的柯南靠放在车旁，还对柯南用英文道了一句晚安，随后她拉起自己右腿的裤腿，取下了绑在小腿处的手枪。