自诺伊和奈克瑟斯战败之后，视频迅速火遍全网，加上如今肉眼可见的黑暗，阳光都以被乌云遮蔽，所有人都觉得世界末日，它真的来了。
此时TLT自由堡垒所有内部人员都在寻找着黑暗扎基的身影，孤门拿到了进化信赖者，这是他们最后的机会。
此时街道上的人们出现了暴乱，将要世界末日，他们都尽情的释放着自己近日的委屈与生活中的种种压抑情绪，大街上情况瞬间乱做一团。
警部迅速派遣武装队伍去维持秩序，为了坚持到光明到来的最后一刻，还有许多市民都在家中祈祷，希望有奇迹发生。
武装队伍的人数有限，而暴乱的群体人数却十分庞大，一时间根本无法完全镇压。这时天空一声巨响，黑暗扎基的身影突然出现在了街道上。
武装队伍和所有的人民群众都被这个在视频里看到的邪恶黑暗破坏神黑暗扎基给吓到了，现在亲眼所见，这令他们更加恐惧。
黑暗扎基很享受他们如今的样子，还觉得这十分的有趣。
“真不错啊，这恐惧和绝望的模样，不如我再加点火如何。”
黑暗扎基从手中释放能量进入刚刚在暴躁打砸的群众身上，能量侵入身体，他们痛苦的在地上翻滚呐喊，不一会，他们居然都变成了异生兽！！！
TLT的异生兽振动波探测器响起。
吉良泽优
“怎么回事，所有异生兽不应该都已经消失了嘛……难道说！？”
吉良泽优立刻打开异生兽出现地点的是监控视频画面，此时异生兽出现的地方，黑暗扎基果然在这里。
和仓队长
“黑暗扎基！”
松永看着画面里面的扎基。
“他是在制造异生兽吗？！”
平木有些不可置信。
“将人类……”
孤门看到这个画面想起了莉子，画面中人类变成异生兽的不断的攻击周围的建筑和人们群众，此时的它们肆无忌惮，完全不像过去的异生兽一样躲藏，也完全失去了人性。
孤门
“不可原谅！！！”
说完孤门就夺门而去，他驾驶切斯塔号直接朝目的地飞了过去，这是和仓队长也不磨叽，毕竟除了黑暗扎基，还有异生兽在那里，即使他们曾经是人类，但是现在他们也确确实实的在伤害着人民群众，为了避免更大的伤害，只能将其消灭掉了。
夜袭队从原本的六个人到现在只剩三个人能够战斗了，虽然和仓队长有些难过，但是他并没有选择放弃。
和仓
“夜袭队，出动！“
平木
“了解！”
两人也迅速出击，如今是生死存亡时刻，不仅是夜袭队，在自由堡垒里没有一个人会选择轻易放弃。
此时的海本还和来访者沟通，希望能够从来访者那里获得关于黑暗扎基更多的信息。
街上已经乱作一团了，现如今又出现了许多异生兽在攻击群众，群众躲在家里也已经不安全了，TLT也调遣了部分武装队伍去对付异生兽，但奈何他们的武器装备有限，根本无法消灭异生兽，只能抵挡一阵子。
孤门驾驶切斯塔战斗机来到了街角上空，看见了黑暗扎基和异生兽攻击群众的画面他愤怒不已，于是他向黑暗扎基发起攻击，但黑暗扎基似乎已经意识到了孤门的到来，直接挡下了孤门的冲击波射线和导弹。
孤门
“可恶！！！”
黑暗扎基看见切斯塔号战斗机也是直接发射扎基射击给予回应。射线的速度很快，孤门眼看射线即将命中，于是果断选择跳伞。
黑暗扎基
“我说过了，你们就是虫子，虫子还想打败我，简直就是痴心妄想。”
孤门飞在空中，他愤怒的看着黑暗扎基，他看着手中的进化信赖者，曾经和姬矢准，怜，还有诺伊的回忆出现在孤门的脑海中。
姬矢准
“孤门，光是纽带，当传到下一个继承者的时候，它会再度发出光芒！”
千树怜
“感谢你像哥哥一样照顾我，孤门，是你给了我战斗的勇气！”
最后孤门想起诺伊在最后战斗中看自己的眼神。
诺伊
“不要放弃！”
孤门一手握住进化信赖者，另一只手拔出进化短匕。
“啊啊啊啊啊！！！！”
一道红色的光芒闪烁，奈克瑟斯再次出现。
此时在医院的停尸间内，无数的光芒汇聚于诺伊体内，似乎是感觉到了诺伊恢复的生命力，它们也在帮助诺伊快速恢复身体上的其余伤口，血脉之力再一次觉醒，血脉之力似乎在抵制着光芒，但好在诺伊身体有着另一股光的力量与之相调和，这个世界的光慢慢被诺伊的身体所接受，诺伊的身体以肉眼可见的速度恢复。
在战场中，奈克瑟斯开始和黑暗扎基交战，奈克瑟斯直接冲向扎基挥拳而去，而黑暗扎基也是礼尚往来。
光的力量再一次得到加强，奈克瑟斯此时并没有如此弱不禁风，奈克瑟斯都用尽全力朝对方攻击而去，孤门都明白，这可能是自己的最后一战了。
孤门
“扎基！！！”
孤门想起姬矢准，于是立刻变换成为了红色形态的奈克瑟斯，两人的攻击直接打出绚丽的火花。可惜奈克瑟斯还是稍逊一筹，被黑暗扎基一脚踢腿，但这也正好给了奈克瑟斯释放终极必杀的机会。
奈克瑟斯直接凝聚层叠风暴，黑暗扎基反应不及时，于是直接被奈克瑟斯的层叠风暴击中打飞，奈克瑟斯乘胜追击。
千树怜曾经战斗的画面出现在孤门脑海中，孤门再一次变换成为蓝色奈克瑟斯飞向空中继续攻击黑暗扎基，誓死不给他留下一丝喘息的机会。
黑暗扎基
“可恶，以为这样就能打败我嘛！”
黑暗扎基被奈克瑟斯缠住，一时间根本无法脱身，只能硬接来自奈克瑟斯的疯狂攻击。好在黑暗扎基也不是吃素的，虽然蓝色奈克瑟斯可以进行空战速度很快，但力量方面却不是黑暗扎基的对手。
黑暗扎基抓住机会将蓝色奈克瑟斯摔飞，随后立刻释放能量火花雨攻向奈克瑟斯，面对如同雨点般飞来的攻击，蓝色奈克瑟斯开启十足马力闪避，可最后还是被击中直直的朝地面坠落。
和仓
“孤门！”
平木
“孤门！”
吉良泽优
“不好了！”
就在奈克瑟斯即将坠落地面之时，一道白色的光芒出现，在被乌云遮蔽没有光芒的世界，这道光芒的出现让所有人一时间都无法睁开眼睛。
当光芒散去，奈克瑟斯身后出现了一道身影将他牢牢接住了。
吉良泽优
“这是！！！”
和仓
“不会吧！”
平木
“死而复生了？！”
奈克瑟斯回过头去，看见了一个熟悉的身影，他再一次救了自己。
“诺伊！！！”
诺伊
“一起上吧，孤门。”
奈克瑟斯
“好。”
黑暗扎基
“怎么可能，怎么会有这样的事情，你确确实实死了才对！？”
诺伊活过来了，这一情况让黑暗扎基都觉得难以置信，因为他当时是亲自确认过诺伊已经死亡了的。
诺伊
“我懒得和你废话，你不配听！”
奈克瑟斯和诺伊两人迅速出击。
黑暗扎基
“哼，杀过你一次就能杀你第二次，虫子在我面前也只能是虫子！”
三人迅速交战在一起，这一次两人和黑暗扎基打的势均力敌，有着诺伊的加入，黑暗扎基发现自己居然没能第一时间拿下他们，而且还是在黑暗领域的状态下。
诺伊单手举天
“艾美尔领域！！！”
黑暗扎基带着戏谑说道。
“你应为你能召唤的出来嘛。”
但今时不同往日，因为之前帮助诺伊疗伤的光芒是来自于奈克瑟斯遗迹，也就是说，能让诺伊如此快恢复的人可能是……
这一次的艾尔领域有了之前进入诺伊身体，奈克瑟斯遗迹光芒的加持，艾尔领域进化成为了更强的艾美尔领域，而艾美尔领域竟然真的破开了黑暗领域的一小部分，阳光透过乌云照射大地，被阳光所照射的地方，这就是艾美尔领域的范围。
艾美尔领域可以像黑暗扎基的黑暗领域一样释放，无需将人带入亚空间。
黑暗扎基
“这怎么可能！？”
诺伊
“没有什么是不可能的，就像你今天注定会败，注定会死在这里，我……已经看到了结局！”
黑暗扎基
“那就让我看看今天谁会死在这里！”
黑暗扎基急速向诺伊冲来，诺伊不闪不避，直面黑暗扎基，在艾美尔领域中战斗，诺伊现在丝毫不惧黑暗扎基。两道人影的攻击似如电光火石，人们只能看见他们的幻影，而在他们严重的幻影，在速秒之内就已经交手了上百招了。
处在艾美尔领域的诺伊如今确实可以做到和黑暗扎基五五开了，甚至还有力压黑暗扎基之势。再加上奈克瑟斯，如今的黑暗扎基可以说是被两人正义的二打一压着打。
诺伊心想，必须速战速决，艾美尔领域存在的时间不长，如果艾美尔领域消失了，那战局可能再一次发生变化。
黑暗扎基似乎也发现了这一点，这一次他被两人的攻势所伤，但他很聪明的没有选择硬碰硬，而是采取了游击战。
奈克瑟斯
“不要逃，黑暗扎基！！！”
黑暗扎基有些生气，但他并没有上头，他心里想着，不过是两只虫子而已，等艾美尔领域消失，他就直接捏死这两只死虫子。
诺伊还在想着消灭黑暗扎基的办法，而奈克瑟斯更想将黑暗扎基消灭，于是奈克瑟斯见扎基受伤，马力全开的自己一个人追了上去。
吉良泽优
“不好了，诺伊的艾美尔领域相位波动变弱了，可能马上就要消失了。”
和仓一听脸上顿感不妙。
“什么，那不就是说孤门现在很危险！！！”
黑暗扎基朝诺伊释放能量火花雨拖住诺伊，随后直接和奈克瑟斯战斗，此时艾美尔领域消失了，黑暗扎基也终于不再畏手畏脚。奈克瑟斯与之交战，谁知还不到一会，等诺伊赶到时，奈克瑟斯就已经被黑暗扎基掐着脖子一动不动的来到了诺伊面前。
诺伊心想
“糟了，这下麻烦了，孤门你倒是上你大号说话呀！！！！！！”
黑暗扎基
“诺伊，现在奈克瑟斯在我手上，只要你敢动手，我就直接杀了他。现在你就乖乖的站着，然后被我攻击吧，不能闪躲，不然你知道后果。”
黑暗扎基直接释放能量火花雨攻向诺伊，无数的火花打向诺伊，在完全不防御的状态，诺伊一定会受重伤的。
和仓
“诺伊！！！”
平木
“真卑鄙呀！”
这时吉良泽优看着电脑画面，这一次要是再输了，世界就真的要毁灭了。
诺伊承受完了黑暗扎基的攻击还是站了起来，这一点让扎基明白了诺伊确实是能够对自己造成威胁的人物，必须尽快消灭。
诺伊此时站起来就已经有些吃力了，黑暗扎基也看出了诺伊的状态，于是他果断将奈克瑟斯放下，随后立刻双手立刻凝聚扎基闪电，想要直接杀掉诺伊。
吉良泽优看着电脑屏幕大喊
“诺伊，快逃！！！”
和仓也见势不妙
“冲击波射线发射！！！”
切斯塔号的攻击并未打断黑暗扎基的施法，扎基闪电释放，就在这时，奈克瑟斯突然飞驰而来将诺伊救下，扎基闪光没有打中诺伊，被攻击的地面发生的超大范围的爆炸，切斯塔号直接被这余波震飞了出去，战机直接变得破损不堪。
黑暗扎基
“这怎么回事，他怎么可能还有力气。”
诺伊看见面前的光芒，悬着的心终于放了下来。此时的奈克瑟斯全身发着亮光，随后进入变身成为了诺亚。
吉良泽优
“那是！！！”
海本
“来访者口中的……诺伊奥特曼？！”
当时他询问黑暗扎基有什么弱点，然后才能消灭黑暗扎基。来访者告诉海本，黑暗扎基基本上没有弱点，他是我们仿造曾经的保护者诺亚奥特曼而制造出来的，如果想要打败黑暗扎基的话，除非诺亚奥特曼……
此时此刻神秘四奥之一的诺亚奥特曼出现了，孤门一辉终于在最终时刻想起了大号密码。
诺亚奥特曼将诺伊放在了安全的地方之后，直接飞向空中与黑暗扎基进行交战，虽然黑暗扎基很强，但诺亚的实力力压黑暗扎基。
黑暗扎基
“可恶……”
话还未说完，诺亚奥特曼的拳头已经到了，他一拳打向黑暗扎基的腹部，黑暗扎基直接被诺亚奥特曼打飞几十米远。黑暗扎基释放能量火花雨攻击诺亚奥特曼，诺亚奥特曼直接使用奥特屏障将所有能量全部都挡了下来，并且一往无前的冲向扎基。
两人的战斗十分激烈，但战况确是诺亚奥特曼的绝对碾压，两人的每一次轰拳都会造成小范围的音爆，但每一次被打退的都是扎基，而诺亚奥特曼不给黑暗扎基反击和喘息的机会。
黑暗扎基被诺亚奥特曼在空中连续暴击，随后诺亚蓄力旋转一拳将黑暗扎基打飞至外太空。
黑暗扎基用尽全力将拳力抵消，随后名场面来了，诺亚奥特曼和黑暗扎基的世界级对波。
黑暗扎基愤怒的嘶吼着。
“我是不会输的！！！”
黑暗扎基在外太空凝聚扎基闪电，而诺亚奥特曼在地球凝聚诺亚闪电，两人的光线同时释放，相撞。
诺亚奥特曼的诺亚闪电打的扎基闪电节节败退，最后直接将扎基闪电打散，诺亚闪电直击黑暗扎基。
黑暗扎基
“这不可能……”
黑暗扎基在诺亚奥特曼的诺亚闪电下化为了灰烬，黑暗扎基被消灭了，诺亚单手举天，一道能量释放，瞬间将笼罩世界的乌云全部打散。市民们看见阳光纷纷走出门外，他们看见了诺亚，看见了拯救了世界的诺亚奥特曼，并且这一次不需要再忘记，再也不会忘记。