小智等人回到海岸上，露佳开船回来了，小智等人把事情告诉露佳…
小智：" (若有所思)"
阿弘：" 小智，怎么了？"
小智：" 我觉得火箭队不可能就这么善罢甘休。"
小刚：" 确实，那些家伙很难缠。"
小智想了想，走到海岸边
小智：" 出来吧，暴鲤龙、美纳斯、巨钳蟹。"
阿弘：" 好漂亮的神奇宝贝。"
小霞：" 对吧，以前我看到的时候也是这样。"
小智：" 暴鲤龙、美纳斯、巨钳蟹，麻烦你们潜入海中看看有没有什么可疑的东西，比如建筑物之类的，如果发现的话，就使用破坏死光破坏它。"
暴鲤龙它们点了点头，潜入海中寻找了起来……
暴鲤龙：" 吼～(找到了。)"
美纳斯和巨钳蟹跟着暴鲤龙游到深海，看到一座蛋形建筑物…美纳斯、巨钳、暴鲤龙发出一道紫黑色的能量光束，打在蛋形建筑物上
“轰——！！”
海水倒灌进建筑物里面
“呜～呜～呜～”
南波博士：" 怎么了？发生什么事了？为什么会响起警报？"
火箭队成员A：" 南波博士，不好啦，上方的甲板突然受到了神奇宝贝的攻击，海水开始倒灌进来了，动力系统也受损了。"
南波博士：" 你说什么！"
火箭队成员B：" 丹波博士，现在怎么办？"
南波博士：" 不是丹波！是南波！现在赶快上升，还有快去排水，不管多少，能排多少是多少！"
众人：" 是！"
“咕噜噜～”
蛋形建筑物开始脱离海底，徐徐上升，渐渐朝海面升去，暴鲤龙、美纳斯、巨钳蟹见状，连忙游向小智游去
阿弘：" 大家快看，那是什么？"
小智等人看向阿弘所指的方向，看到一座不断的冒出缕缕黑烟的，似乎还在不断的上升的圆形建筑物
小霞：" 哇，那是什么呀？"
小智：" 果然不出我所料，那应该是火箭队的海底基地。"
这时，暴鲤龙、美纳斯和巨钳蟹回来了
小智：" 暴鲤龙、美纳斯、巨钳蟹，你们做的很好。"
“轰——”
一阵阵浪花高高溅起，圆形建筑物浮出了水面
小银：" 呜～呜～"
修一：" 你怎么了？小银。"
这时，一声悠久的叫唤从海底传出，渐渐的变得尖锐，一个巨大的身影破出水面，洛奇亚高大的身影出现在众人眼中
修一：" 洛奇亚，你要小心呀，刚才有人要抓小银。"
洛奇亚：" 呜～"
洛奇亚四处扫视，看到远处的圆形建筑物，怒吼一声，朝圆形建筑物飞去
小智：" 等一下。"
小智带着皮卡丘骑上暴鲤龙
小智：" 快追上去。"
暴鲤龙追向洛奇亚，美纳斯和巨钳蟹紧随其后
小霞：" 等一下，小智！"
小刚：" 我们也追上去。"