随后，超梦带小智和火箭队来到它藏身之所…小智和超梦透过洞穴里面的屏幕，监视火箭队
超梦：" (战斗，这个办不到，人类，他们是创造我们的生身之父，既然这样，只好再出去旅行流浪，寻找我们的安身之处了。)"
小智：" (这就是你的决定吗。)"
小智走出洞穴，看到被妙蛙花和妙蛙种子用藤鞭捆起来的火箭队三人组
小次郎：" 搭救我们的人差不多该来了吧。"
武藏：" 高兴的太早啦，我们这副惨兮兮的样子不能让坂木老大看到。"
喵喵：" 嘘，现在那只皮卡丘要做重大发表了喵。"
复制皮卡丘：" 皮卡～皮卡皮卡～皮卡丘～皮卡～"
喵喵：" 这样下去，我们会被他们抓住，搞不好还会变成实验材料啊喵。"
复制皮卡丘：" 皮卡～皮卡皮卡～皮卡丘～"
喵喵：" 错过现在就没有逃出去的机会了。"
复制皮卡丘：" 皮卡～皮卡皮卡～皮卡～"
喵喵：" 我们的目标是寻找广大的世界喵。"
小次郎：" 既然这样，就拜托大家好了。"
武藏：" 也带我们一起走嘛，好不好？"
小智：" 皮卡丘，我跟着超梦，你跟着它们，我们分头行动。"
皮卡丘：" 皮卡～"
而后，复制皮卡丘它们把武藏和小次郎关进了洞穴里面的牢房里面
武藏：" 这到底是什么地方啊？"
小次郎：" 怎么看都像是牢房啊。"
喵喵：" 你们太天真了喵，火箭队是它们的敌人，怎么可能带我们走呢喵。"
武藏：" 可是，为什么只有你没有被关起来啊？"
喵喵：" 我是可以讲人类语言的神奇宝贝，对它们有很大的帮助。"
小次郎：" 可是…"
喵喵：" 我们的交涉就像月亮一样的圆满达成了喵。"
武藏：" 什么嘛，太过分太不公平了啦。"
复制皮卡丘：" 皮～皮卡丘～"
喵喵：" 出发了喵。"
复制皮卡丘带着复制喵喵、水箭龟、比雕、白海狮、胖可丁、暴鲤龙、九尾、水精灵、哥达鸭、沙瓦郎跑出洞穴，皮卡丘看了看火箭队三人组，然后跟着跑了出去
小次郎：" 啊，是小鬼头的皮卡丘。"
武藏：" 为什么它也在一起啊？话说，为什么小鬼头没有被关起来？"
喵喵：" 你们放心吧，我一定会代替你们抓到皮卡丘，然后把它送给坂木老大的喵。"
小次郎：" 那么功劳不就…"
武藏：" 被喵喵一个人独占了。"
喵喵：" 这里就交给我来吧喵，事成之后，我会分一点我的神奇宝贝食物给你们的。"
武藏、小次郎：" 谁稀罕啊！"
小智和超梦还有复制喷火龙、妙蛙花、妙蛙种子、杰尼龟、霸王花、烈焰马、飞天螳螂、铁甲犀牛、尼多后、穿山王、六尾、可达鸭站在悬崖边上，看着正在渡河的复制皮卡丘它们
小智：" 不阻止它们吗？"
超梦：" (去者不留，有的人自愿留下来，在这里的话，我是能够以我的力量保护它们，但是，就算它们是我创造出来的，也不能凭着我自己的意思阻止它们想要自由生存的意愿、它们的自由，我该如何是好呢？)"
天亮了，复制皮卡丘、复制喵喵、水箭龟、比雕、暴鲤龙、白海狮、胖可丁、九尾、水精灵、哥达鸭、沙瓦郎和喵喵、皮卡丘抵达了对岸
喵喵：" 呼喵，到了喵。"
复制皮卡丘：" 皮卡皮卡～"
喵喵：" 大家都平安无事喵。"
就在这时，突然出现了一架涡轮直升机，涡轮直升机射出奇怪的红色光球，把复制神奇宝贝们全部定住了，紧接着，从黄色飞艇空里面投出的许多黑灰色，有‘R’字的精灵球，奇把复制神奇宝贝全都收了进去。皮卡丘跟喵喵帮助复制皮卡丘和复制喵喵摆脱了束缚，但涡轮直升机不断的射出奇怪的红色光球，把它们逼到了死路，无处可逃。就在皮卡丘、喵喵和复制皮卡丘、复制喵喵就要被红色光球打中时，一颗黑色的能量球抵消了红色光球。皮卡丘它们抬头，看到超梦，超梦朝涡轮直升机扔出一颗黑色的能量球，涡轮直升机退后，躲开了能量球。超梦手一挥，把被抓进精灵球里的复制神奇宝贝们全都释放了出来。
一架涡轮直升机飞到超梦面前，上方舱门打开，坂木和朵米诺升了上来
超梦：" (你是…)"
小智骑着血翼飞龙赶了过来
坂木：" 我们又碰面了，超梦…以及，真新镇的小智。"
小智：" 坂木…"
超梦：" (我的力量已经比以前跟在你身边时还要强更多，你真的以为你有能力随心所欲地操纵我吗？)"
坂木：" 没错，你的确比以前厉害多了，但是，我们人类的技术却可以制造出把你的力量封印起来的机器。"
直升机两侧的舱门缓缓打开，从里面飞出了两个分别涂装成黑色和红色的机器人，机器人上安装着一个硕大的球形玻璃晶体，看不到明显的飞行装置却稳稳地悬浮在空中快速移动，一左一右地将超梦包夹起来。两台机器人上的玻璃晶体同时一亮，从短小的突起上亮起了闪亮的蓝色电弧，在空中结成一张电网，将超梦包围了起来，身处电网中的超梦只觉得身体一阵异样，加持在自身用以维持飞行的念力便被强制驱散了，掉了下去，砸在地面上
小智：" 超梦！"
坂木：" 怎么样，知道我们的力量是不可小看的吧。"
超梦：" (起身)(你以为连心都没有的机器有能力把我打倒吗。)"
坂木：" 就是因为连心都没有，所以才能够抓住你，这是它唯一的目的。"
两台机器人再次包夹超梦
超梦：" (你做梦。)"
坂木：" 提高马力。"
朵米诺操机器人加大马力，放出比先前更加强烈的电网，将超梦包围在其中，在缓缓逼近的同时，将电网进一步收缩，似乎打算就这样用电网将超梦给捆起来；超梦慢慢举起泛着蓝光的双手，然后用力向外一推，强大的念力便轻而易举地突破了电磁网，将两台机器人狠狠弹开。被弹飞的机器人撞在不远处的岩石上，冒起一阵电火花后，像是故障了一般，掉落在地上，不再动弹
坂木：" 真不愧是超梦，知道没有心的机器不可能有真正强大的力量，这一点我也了解，但是你别忘了，心也有它的弱点。"
超梦：" (你还没有死了打赢我的心吗？)"
坂木：" 跟你正面交手没有胜算，但是，战斗的舞台是那座小岛。"
坂木指向湖中心的小岛，小智和超梦才发现火箭队全员已经几乎抵达小岛
朵米诺：" 这里是009，朵米诺，作战开始！"
朵米诺背着喷射背包，飞了过去
坂木：" 超梦，你的同伴应该不光是在场的这一些吧，留下来的那些同伴你能放弃不管吗？"
超梦：" (你这个小人！)"
小智：" 卑鄙的家伙！"
坂木：" 这两句话，我就当作称赞收下了。"