小智等人追着卡戛其来到神奇宝贝研究场馆
卡戛其：" 到了…不好了，还是来晚了。"
米娅：" 哥哥，你到这里来干嘛？"
卡戛其：" 这个嘛…"
托里托：" 关、关于…神、神奇宝贝…"
工作人员A：" (小声)托里托，放视频啊。"
托里托这才反应过来，拿出遥控器，按下按钮，打开大荧幕，但放出来的却不是研究视频，而是收服大赛的录像…一位研究人员连忙跑上前，拿走托里托手上的遥控器，按下按钮，关闭了大荧幕
米娅：" 哥哥，这到底是怎么回事？"
卡戛其：" 这个嘛…"
卡戛其连连后退，不小心撞到了人，从卡戛其身上掉下来一颗精灵球，精灵球打开，里面空空如也
莉莉：" 舅舅，这是…"
卡戛其：" 不是，这是那什么…"
莉莉：" 舅舅是…骗子吗？"
卡戛其：" ……"
莉莉：" (哭泣)舅舅是骗子…我讨厌你！"
莉莉哭着跑了出去
卡戛其：" 莉莉！等等！"
莉莉跑去没多远，就身体不舒服的跪坐在
地上
卡戛其：" 莉莉！"
卡戛其和米娅跑到莉莉身边
卡戛其：" 没事吧？莉莉。"
这时，场馆内突然冒出浓浓的烟雾，引起一片混乱
翡翠：" 有小偷！小偷刚刚逃走啦！"
小智带着皮卡丘和雷丘追向小偷，但中途跟丢了，只好回到神奇宝贝中心…
托里托：" 怎么样了？"
小智：" 抱歉，在半路上跟丢了。"
皮卡丘：" 皮卡皮卡～"
小智：" 伊布受伤了！"
利莎：" (抱着伊布)嗯，它被慌乱逃跑的人群踩伤了，不过刚才让乔伊小姐检查过了，没什么大碍。"
小智：" 那就好，对了，被小偷偷走的是什么东西？"
托里托：" 是孢子的药剂。"
小智：" 通知君莎小姐了吗？"
托里托：" 已经报过案了，之后警方会继续追查。"
翡翠：" 折腾了一天，大家都累了，回去休息吧。"
随后，小智等人回去休息…第二天早上，小智打开房门，就看到利莎抱着伊布站在门口
小智：" 利莎。"
利莎：" 那个，外面很热闹，好像出了什么事。"
而后，小智和利莎走出神奇宝贝中心，看到风车的旋转速度变慢了
路人A：" 听说风力变小的原因可能是圣火突然不见了。"
路人B：" 不见了！是整个都没了吗？"
路人A：" 对。"
路人C：" 都出这么大的事了，还办什么啊。"
小智：" 圣火不见了。"
随后，小智和利莎来到了放置圣火的高塔下
小智：" 市长。"
欧里巴市长：" 小智。"
小智：" 我听说圣火不见了。"
欧里巴市长：" 对。"
小智：" 所以风就停了。"
欧里巴市长：" 洛奇亚是以圣火为地标来送风的，但是现在…"
利莎：" 圣火没了，洛奇亚就不知道该往什么地方送风了？"
欧里巴市长：" 对。"
翡翠：" 要在风节结束前，也就是明天天亮前找回圣火，不然…"
欧里巴市长：" 不然这座城市的电力就被耗尽。"
利莎：" 不会吧…"
小智：" 我可以到上面看看吗？"
欧里巴市长：" 可以。"
而后，小智和利莎搭乘电梯，来到塔顶
利莎：" (趴在地上)我有恐高症，跑到这来，是要我的命啊。"
皮卡丘和伊布嗅着四周的味道
皮卡丘：" 皮卡丘～"
小智：" 看来有线索了。"
利莎：" 又要下去了吗…"
随后，小智和利莎跟着皮卡丘，一路来到神奇宝贝研究场馆，皮卡丘嗅着味道，趴到了图图犬身上
托里托：" 怎么了？皮卡丘。"
利莎：" 难道说，偷走圣火的犯人是图图犬吗？"
皮卡丘：" (摇头)皮卡皮卡～"
小智：" 圣火被偷走了，所以皮卡丘就寻着气味，一路跑到了这里。"
利莎：" 结果找到了图图犬。"
托里托：" 图图犬的气味…是图图犬的墨水吗？"
皮卡丘：" (点头)皮卡皮卡～"
托里托：" 该不会是…当时我以为瓶子是自己从桌上滑落的。"
小智：" 看来是有人…"
托里托：" 我也不太清楚，如果真是那样的话…"
随后，小智等人来到塔顶
托里托：" 图图犬通常会用墨水来标记属于自己的地盘，我们以此为基础改良并制造出了一种更加实用的透明药剂，不过只要用这光一照…"
托里托拿出一支紫外线手电筒，按下开关，照射出了一串脚印
托里托：" 果然没错。"
欧里巴市长：" 好厉害。"
小智：" 皮卡丘，你立功了。"
皮卡丘：" 皮卡丘～"
托里托：" 只要跟着这个，应该就可以找到犯人的踪迹。"
小智：" 我们走吧。"
托里托：" 嗯。"
随后，小智等人跟着脚印，一路走到山区的废墟，看到拉茹果正在和两个神奇宝贝猎人对峙，其中一个神奇宝贝猎人扣下扳机，射出一张捕获网
小智：" 铁尾！"
皮卡丘一跃而起，尾巴发出白光，身体一扭，把捕获网切碎了
盗猎者A：" 什么！"
小智跑到拉茹果前面
小智：" 你没受伤吧，拉茹果，你做得很好。"
欧里巴市长：" 我是风来城的市长欧里巴，如果你们两个再不收手的话，我将采取法律措施。"
盗猎者A：" 情况不妙。"
盗猎者B：" 暂且先溜了。"
盗猎者A：" 好。"
神奇宝贝猎人们收回各自的神奇宝贝，想要逃跑
小智：" 雷丘，使用电网！"
雷丘跳起来，在尾巴上凝聚出电网，扔向神奇宝贝猎人们，把他们网住了
小智：" 干得好，雷丘。"
雷丘：" 雷丘～"