忍者村是忍者聚集的地方，一般有忍术学院和类似部队编制的忍者，接受各种委托任务。
而忍者和忍者村正是一个国家军事力量的象征，拥有很高的地位。
不过，忍者村虽享有高度的自治权，但仍是一个隶属于所在国的机构，特别重大的决策需得到大名的同意才行。
例如：影的选拔。
忍者村由影（首领）管理，为国家提供必备的武力支撑，同时，国家也要为忍者村各项发展和日常花销提供财政拨款。
它们相互依存，共同强盛。
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木叶忍村。
由初代火影、二代火影与宇智波一族的最强者共同建立。
是忍界史上的第一个忍者村。
其所在的火之国，位于中心地带，是交通要塞，也连接着南北，十分繁荣。
这样独特的地理位置使火之国聚集着大批的人才与资源，成了五大国中军力最为强盛的国家。
这个忍者村的名字，来源于森之千手一族的“木”（千手一族领袖千手柱间拥有木遁的血继限界）与代表宇智波一族的“叶”（宇智波一族的族徽外形是扇叶）。
木叶村的整体，排布为扇形。
只要走进这个村子，便能一眼看到最高峰上雕刻的历代火影的石像。
它们是木叶的标志。
而站在那里，可以俯瞰整个木叶。
木叶村有自己的管理机制，也就是火之体系——由六个较大的部门分别管着木叶的各项工作，使木叶村运行无误，焕发勃勃生机。
【暗部】：由二代火影所建立的暗杀战术特殊部队，由火影直接指挥。其成员都是从村子里筛选出的优秀忍者，主要负责保护火影和预防外敌侵入，有时还负责侦查敌情、暗杀等。
暗部成员行动时，会戴着白色的动物面具，任务性质与其他一切资料均为秘密。
【根】：暗部培训部门。是直接隶属于木叶元老志村团藏的独立组织，即不受火影的管制，也不受暗部所管辖，制服是白色或黑色披风。
团藏和根是木叶最直接有效的利剑，时常以“宁错杀，不放过”的强势姿态铲除村内外一切威胁。
【行政部】：辅助火影管理木叶政务的机构，其最高长官是水户门炎和转寝小春，他们的地位相当于村中的长老。
除了辅助火影工作，给予一些正确性的意见，他们也作为火之国与木叶的桥梁，传达国家的信息及接受国家拨给村子的财政支出，同时向大名反应村子的一些状况和形势。
【医疗部】：原先并不发达，是由三忍之一的千手纲手提出“四人战斗小队中配一名医疗忍者”的历史性方案使木叶的医疗部有了突破性发展。时至今日，医疗部已经分成急救医疗班、尸体处理班、驯兽疗养班等多个分支系统。
【教育部】：忍者的摇篮之地。由二代火影建立的木叶忍者学校，确保了教育稳定性和人才培养效率。
【解析班】：其成员能使用读心之术进入敌人的脑中，窥视记忆，从而读取情报。