晚宴开始，主办人早已等候多时，应邀而来的八位宾客依次入座。
晚宴的主办人用紫色的三角头套遮住面容，双眼冒出诡异的红光，一动不动地坐在主座上。
主办人邀请侦探们和他玩一场游戏，一场赌上性命的游戏！
与此同时，侦探们停在门外的车和通往外界的木桥全部被炸毁。
主办人称只要他们解开黄昏公馆谜题，找到沉睡了40年余的宝藏，他就会告诉他们离开这里的方法，并且分一半的宝藏给他们。
柯南知道不对，这不过是主办人编出来的谎言，来诱骗他们去寻找隐藏在这座公馆里的宝藏，但这里的主人根本没打算放他们活着离开，最后他们都会死在这里。
而且邀请他们来的主办人并不是落款神之所弃幻影之仔中隐喻的怪盗基德，这只是个装着录音机和扩音器的假人，真正的怪盗基德现在正坐在他的身边。
毛利小五郎忍不住打了个哈欠，这些话他都听腻了。
柯南无语地问道：“毛利叔叔，你很困吗？”
“自从来到这座黄昏公馆，我已经连着12晚没有睡了，今天是第13晚。”毛利小五郎有气无力地说，“13啊，真是个不吉利的数字。”
不止是13晚没睡觉，而且这13次的晚餐都是毛血旺，水煮鱼和麻婆豆腐，他的腚啊，没什么感觉，但他的胃快吃吐了！
“诶？”柯南听得晕头转向，“毛利叔叔，你在说什么傻话，我们明明今天才来的啊！”
“真的是这样吗？”毛利小五郎露出不同于平常的表情，“小侦探，江户川柯南。”
柯南眼神锋利，盯着眼前的毛利小五郎，说：“你果然是……”
“嘘！”毛利小五郎把食指挡在嘴前，“马上就要开始了，第13场，不可思议的华丽魔法笼罩下的悲剧。”
“啊——！”
在熟悉的惨叫声中，美食家侦探大上祝善瘫倒在地。
白马探和茂木遥史立刻上前，但人已经死透了，死因是氰化钾中毒，但将10元硬币放在死者的杯中并未检测出氰化物。
主办人还在继续说：“你们已经陷入我所施的魔法当中了，为了报答大上侦探牺牲了自己的性命，让这场游戏热闹地开场，请大家尽全力把宝藏找出来吧！趁着你们还活着的时候……”
“混蛋！别开玩笑了！”茂木遥史粗暴地拎起假人到领子，假人的头落在地上，掉出里面的录音带。
柯南没有心思参与这桩杀人案，他满脑子都是怪盗基德的话，他有预感那些话里隐藏着真正的幕后黑手。
趁着其他侦探去查看被主办人炸毁的车子之时，柯南和毛利小五郎两人单独留在公馆里。
“你刚刚说的那些话是什么意思？”柯南目光如炬盯着眼前的这位毛利小五郎，“怪盗基德！”
毛利小五郎不慌不忙地问道：“那么小侦探，你有什么证据证明我就是怪盗基德呢？”
柯南笑道：“当然是因为毛利叔叔的烟瘾很大，你从进门到现在都没有抽烟，不觉得很奇怪吗？”
“可我们从进门到现在不过两个小时而已，而且我的烟在路上被千间婆婆没收了。”毛利小五郎摊手无奈地地，“我上哪找烟抽啊！”
“诶？”柯南哽住了，随后耍赖地说，“那你让我捏一下你的脸，你绝对是怪盗基德！”
“好了好了，不闹了。”毛利小五郎连连后退，“我承认我就是怪盗基德，但现在我们先不谈这个问题，我有一件更重要的事情要告诉你。”
“什么事？”柯南用麻醉手表对准怪盗基德，如果这个小偷说不出来一个所以然的话，哼哼！
怪盗基德也不卖关子，直接说：“现在是我们第13次经历这个魔法之夜。”
“魔法之夜？”柯南用看傻子的眼神看怪盗基德，这傻子是偷宝石时被宝石砸脑袋了吧？
怪盗基德深吸一口气，不能和无知的人计较，说：“我知道我接下来说的事情，你会觉得很荒唐，但你的直觉会告诉你这一切都是真的。”
怪盗基德是在加油站和毛利小五郎互换身份的，他以毛利小五郎的身份参加这次晚宴。
和今晚发生的事情一样，宴会的主办人开始炸车炸桥，讲述了40年前乌丸莲耶家的惨案，并要求他们找出乌丸家的宝藏，接着毒死了大上祝善杀鸡儆猴，紧接着千间降代被炸死并坠崖。
之后，他们剩下的人开始搜查黄昏公馆，在钢琴里找到了40年前乌丸莲耶的暗号和被害人留下的血字。
在推测出案件的真相后，他们集体演了一出自相残杀的好戏，骗出了凶手，那就是早已死亡的千间降代。
千间降代和大上祝善就是邀请他们的人，千间降代只是想解开在40年前害死他父亲的谜题，而大上祝善的目标只有宝藏，他打算在取得宝藏后杀死所有人，千间降代只好先下手为强。
这时，柯南很简单的解开了宝藏的暗号内容，那就是把唯一的时钟的时针和分针按暗号顺序旋转，最后他们得到了一个黄金钟。
千间降代终于得偿所愿，开始忏悔自己的罪过。
正当侦探们以为事件全部结束，准备离开黄昏公馆之时，意外发生了，那位金发执事带着他的ak47，将他们永远留在了这里。
当怪盗基德再次睁开眼睛时，他又回到了黄昏公馆前，刚刚把车子停进黄昏公馆门前的时候，车上的柯南，毛利兰和千间降代还在谈论着这座黄昏公馆，只有他还记得那如梦一场的悲剧。
怪盗基德按住衣服里的银币项链，这是临行前小泉红子送给他的护身符，还说了一句莫名其妙的话，只有相信爱与魔法的力量才能破除困境。
魔法？
怪盗基德是个不信邪的，哪来的魔法，他明明是被那个用ak47突突了！
对哦，他明明在突突了，为什么现在还活着？而且还回来了前一天？
所以，刚刚发生了一起，一定是他在做梦。
对，就是这样……在第二次，第三次……事不过三啊！
到现在，今晚他死了又活，活了又死，一共重复了13次！
今晚怎么就过不去了呢！
这不柯学啊！
其实怪盗基德很想金毛执事一句为什么啊？
金毛执事：这一切为了我的恋人！为了我的恋人，化身修罗，在所不惜！
怪盗基德：那是谁啊？
为了拯救世界，关主角团小黑屋的兔川，为降谷零隔空点赞，这就是绝悟啊！