很快，蒙毅从皇陵被调回，随行出城寻药，他被易小川和玉漱动摇了心，拯救几万人性命的愿望还是未能实现。
秦皇嬴政对赵高有所怀疑，却从未想过赵高能投毒，小九知晓剧情，却不能改变这个重要的剧情拐点，痛苦万分。
赵高计算秦皇所中之毒中途便会发作，为以防万一，让金将军带着忠义馆的秘密部队尾随，随时听从他的调遣。
蒙毅利用一切关系寻访长生药。秦皇则立扶苏为太子，由赵高李斯和蒙毅共同辅佐。并且要在他死后，把他所有嫔妃和喜欢的东西都一同陪葬，除了小九。赵高为保自己，煽动李斯修改诏书，改立胡亥为太子。小九什么都知道，却被系统压制，什么也做不了。
经过漫长的等待，长生药终于制成，被举贤堂的人快马加鞭送往秦皇那里。不料途中遭遇袭击，伤亡惨重。
李由浑身是血地杀出重围，为秦皇送上长生药，报告了蒙毅和全体将士阵亡的情况，说罢便昏倒在地人事不省。
赵高听闻喜笑颜开，解决了一个心腹大患，又寻到了长生药，他的未来不用愁了。
玉漱听闻却心灰意冷。母国图安已被秦所灭，与易小川成亲，却在成亲后就被迫分离，蒙毅身死，她所爱的，所爱她的，皆离她所去。
赵高打开药盒，看见三颗长生药。秦皇担心药有毒，要找人试药。玉漱万念俱灰，心中但求一死，好去追随蒙毅，于是主动要求试药。
赵高拿起另一颗药，却送进自己嘴里。
三去其二，嬴政本想给小九的药被赵高吃下，愤怒从心起，加速毒药的循环，直接瘫坐在椅子上。
玉漱想到易小川，想到死去的父母和图安百姓，亦不愿将药递给秦皇。
嬴政眼睁睁看着长生药死去，死前目光从赵高脸上转移到屏风上，死死地盯着屏风，眼眸深处是一抹执念和深情。小九在屏风的后面痛不欲生，但她不能出声，赵高在外面，她不能铤而走险。
小九带着嬴政的御玺和私印，带着一队死忠离开。
嬴政生前受剧情影响，过于相信赵高，身体每况愈下，朝堂上许多事已经被赵高蚕食。小九的能力被系统过多抑制，现在最多就是个健康点的柔弱女子，根本斗不过诡计多端的赵高和八百个心眼的李斯。
她只能走。
李斯宣读赵高已改的遗诏：胡亥登基，为秦二世。
朝堂上，大臣们纷纷启奏事项，赵高就在背后对着胡亥指导，胡亥就听一句说一句。大臣文开实在看不下去，站出来指责赵高原本是个宦官，不应该参与政事。
赵高极为恼怒，利用当年的小川曾经讲过的“指鹿为马”的故事将大臣分为“鹿”帮与“马”帮。赵高把回答是鹿的大臣名字写在一张绢帛上，威胁金将军除去绢帛上的大臣，否则就让玉漱就要为秦皇殉葬。
金将军按着绢帛一一杀死了那些大臣，名单的最后一个大臣竟然是李斯！
他夜闯李斯书房，原本以为的这个最简单的刺杀，成为了金将军最后的绝唱。
这个李斯竟是李由假扮，身手矫捷，快速躲过他一剑。
一剑不成，金将军心中一个咯噔，顿感不妙。
果然，几张大网从天而降，金将军就擒。
等李斯和赵高走入，金将军才知道上了赵高的当，心里说不出是个什么滋味。