曹文诏杀到皇宫大门前，守门的叛军已经逃跑完了。曹文诏一路无阻的攻进了皇宫，想清除皇宫中的叛逆之人，帮皇帝清除宫中祸患。
曹文诏将宫中太监宫女集中起来，把他们吓得跪地发抖。
有士兵来报：发现魏忠贤与客氏在皇上的御书房上吊自杀。
曹文诏马上令人将魏忠贤与客氏的尸体抬下来，并让人放去诏狱。
而祖大寿则分兵缉拿田尔耕、杨衰、孙云鹤、吴淳夫等阉党重要人员。
杨衰和吴淳夫想骑马逃跑，却因为骑术不精被辽东铁骑追上生擒。
田尔耕、孙云鹤、田吉、李实等一众人来不及出城逃跑，于是躲于百姓家中。
魏阉党在占领京城后，放任士兵四处抢掠百姓，调戏良妇，无恶不作。百姓早已对他们恨之入骨，于是在不惊动他们的情况下偷偷告密。不用想，他们全部都被祖大寿擒获。被擒时，他们还大骂百姓无情无义、落井下石。
躲进草丛中的福王也被曹变蛟发现而生擒。
曹文诏清理好皇宫的余党，就去迎接周皇后等人回宫，并加强宫中的警卫。
两天后，孙承宗领五万大军进京。京城中的百姓一知道孙承宗回京，全部都跑出去夹道欢迎。
他们相信在孙承宗的执政下以后的日子有盼头了。
孙承宗到午门外，周皇后已经亲率文武百官等待了。
孙承宗马上下马车上前率众拜见周皇后。
周皇后问道：“皇上呢？怎么不见皇上？”
孙承宗安慰道：“皇后，请勿担心，皇上因一路上颠簸，身体有所不适，先在宁远城休息了两天，要迟两天才回来。”
周皇后才放心道：“皇上没事就好！”
此刻的朱由检正在策马赶路中。
卢象升赶上道：“皇上，已经赶半天路了，还是先休息一下吧!龙体要紧。”
朱由检此刻也觉得有点累了，于是道：“好吧！”于是找了一处阴凉的地方休息一会。
曹化淳马上递水袋给朱由检，朱由检“咚咚”喝了两口，道：“不知京城现在情况如何？”
卢象升劝解道：“据报魏阉党不过是煽动了一些淘汰之兵作乱而已，人数虽有十万之众，但战斗力低下。只要孙阁老一到，他们必败无疑。”
朱由检想想也是，只是心中总是不放心他的皇后，默默不作声。
曹化淳也劝慰道：“皇上，李兵部、马总兵都是善于用兵之人，李若琏、高文采皆是尽忠尽责之辈，皇后当不会有事的。皇上请勿忧。”
朱由检只是“嗯”了一声。
朱由检一回到皇宫，马上就冲去见皇后，看见皇后安然无恙才舒了一口气。
周皇后看见朱由检后，先是愣了一下，马上就扑进朱由检怀里，想起当时紧急情况还有杀出皇宫的惨烈，不由哭了起来。虽然周皇后贵为皇后，性情坚强，但依然是一个小女孩。
旁边的太监宫女见此情形，很知趣的退了出去。
朱由检用脸贴在周皇后头上，右手揽着周皇后的小蛮腰，左手抚摸着周皇后的秀发，口里轻声安慰道：“好了好了，没事了。”花了好一会功夫才把周皇后给安抚好。
朱由检看着周皇后那梨花带雨的俏脸，低下头吻去那晶莹的泪珠。
周皇后俏脸一红，嘴角露出幸福的笑意。
朱由检见状，心中意动不已，趁机吻住周皇后的樱桃小嘴。周皇后先是轻轻的挣扎了一下，然后就慢慢的投入热吻中。
热吻一会，朱由检已经心中生火了，正想进一步行动。
周皇后马上醒觉过来推开了朱由检，喘着气，娇嗔道：“皇上，现在是白天。”
朱由检一听，也不想被人传出去白日宣淫，于是只好罢手。
周皇后整理了一下衣服，道：“皇上，你应该去问候一下懿安皇后了。她在此次叛乱中也受惊不浅！”
朱由检想想也是，于是和周皇后带了一些礼物去看望张嫣。
朱由检一见张嫣就道：“朕此番还没处理好朝中事务就离京，致使乱臣贼子有机可乘祸乱京师，使皇嫂受惊。朕自觉愧对先皇兄之托。”
张嫣连连道：“皇上不必自责，这些乱臣贼子早有此心了，早晚会作乱。古语有云：只有千日做贼，没有千日防贼。如今他们作乱正好全部处理掉。”
朱由检听言，哈哈一笑道：“皇嫂果然是有贤德之人。”
张嫣连连谦让。
朱由检与二女聊了一刻钟左右，就以朝事告辞。
朱由检回到御书房召见孙承宗，问其京城的情况。
孙承宗便把审问出来的事情详细告诉了崇祯皇帝，最后说：“魏忠贤与客氏在皇上的御书房中悬梁自尽。”
朱由检一听此话，只觉后背一阵发凉，寒毛竖起，心中暗骂：“他吗的，这魏忠贤可真会挑地方上吊，怎么感觉有东西看着我？”
孙承宗看到了朱由检如此表情，马上想到自古帝皇皆信鬼神，于是道：“皇上，曹文诏解下魏忠贤与客氏的尸体时发现他们的尸体尚温，并不会对御书房有影响。而且皇上是真龙之体，有万民拥护，上天庇佑，此等宵小东西难近皇上半步。曹文诏也已经用橘子叶重新清理了御书房。”
朱由检当然不会承认怕有鬼的事情，于是镇定道：“俗语有云：人怕鬼三分，鬼怕人七分。没什么可怕的。孙老，你认为如今如何处理魏阉党？”
孙承宗见朱由检竟不信鬼神之说，心中十分欣慰，道：“老臣以为立刻处理掉阉党主要人物，只有他们死了，天下各地阉党余孽就会慢慢离散。”
朱由检也早有此心思了，于是道：“朕也有此意，让朕看一看他们的供词和罪状。”
孙承宗道：“皇上，由于此番牵涉甚广，大理寺正在审理和整理，暂时不能呈给皇上。所有涉及叛乱的主要人员都捉了，唯独逃了重要策划之人冯铨。而参与叛乱的士兵和锦衣卫都被老臣擅自释放了。请皇上降罪。”说完跪了下来。
朱由检举头想了一下，才道：“如今牵涉太监、官员、锦衣卫、还有士兵。若再这样审查下去，一定会造成恐慌。一旦有人煽动士兵，就会有第二次骚乱。孙老的做法是正确的，朕赏赐还来不及，怎么可能会怪罪孙老呢!”说着扶孙承宗起来。
孙承宗以为朱由检怎么样也会有些责怪的，没想到朱由检如此通情达理，心中欣慰不已。
朱由检又接着道：“现在需要的是快刀斩乱麻，把那些主犯杀了，其他人就饶恕了吧！至于冯铨嘛，就让人做个样子去搜查一下，不要再惊动老百姓了。老百姓在此叛乱中已经遭到了祸害。”
孙承宗没想到朱由检如此大度，于是道：“皇上圣明。”
“皇上，锦衣卫指挥使李若琏求见。”外面传来声音。
朱由检直接宣见李若琏，问道是何事。
李若琏道：“回皇上，微臣发现了一批奏章，所以向皇上禀报。”
朱由检道：“哦!拿给朕看看。”
李若琏令人将一大箱奏章抬了上来。
朱由检拿起一本奏章，打开一看，原来是关于魏忠贤和其手下的审讯罪证。朱由检连看几本，便对孙承宗道：“孙老，你也看看吧！”
孙承宗领旨也拿起奏章看了起来。
朱由检看了十几本奏章后，就不想看了，道：“贪污受贿、草菅人命、鱼肉百姓、陷害忠良这么大的罪竟然只判三年，罚银不过一千两银。哈哈哈……”说着说着竟然笑了起来。
孙承宗见皇帝竟然笑了起来而笑声充满着杀意，心中一股寒意升了上来，不由打了一个冷颤，不过又想到东林党竟如此轻判魏阉党，不由叹了一口气。
朱由检把奏章随意的扔回箱里，道：“孙老，你怎么看？”
孙承宗心中一凛，道：“他们罪大恶极，当斩。”
朱由检点头道：“那就麻烦孙老去要此次叛乱的重要人员名单拿过来。”
孙承宗领旨道：“微臣遵旨！但微臣有一事要禀报。”
朱由检一挥手，道：“但说无妨。”
孙承宗道：“福王也参加此次叛乱，有谋反之嫌疑。不知皇上如何处理？”
朱由检一听，反问道：“孙老以为如何处决？”
孙承宗道：“福王乃是皇室宗亲而且还是皇上亲叔，应该由皇上亲自审理。可以的话，可以在大殿上审理他，再轻判他，让天下之人知道皇上是宅心仁厚的。”
朱由检思索了半响道：“福王之事还是先别处理。如果处理太轻，则会引发别的藩王有异心；如果依法处理，那又会引起他人不满。还是先把福王在诏狱关起来，让他熬一熬苦，让他知道什么叫身在福中不知福，非要造反。”
孙承宗见朱由检另有打算，只好赞同。
朱由检把李若琏叫进来，道：“若琏，福王有带亲信在身边吗？”
李若琏道：“福王身边随身跟着一名奉承，人称陈奉承。”